288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0968 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0968  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.669307  normal  0.333056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  40.95 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  36.13 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  36.13 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  40.54 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  35.56 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  29.03 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  27.74 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  27.74 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  27.74 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  37.89 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  27.74 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  33.02 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  39.78 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  35.9 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  31.13 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  27.97 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  28.67 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  34.95 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  38.24 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  38.14 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  39.81 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  35.9 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  33.98 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  38.05 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  33.98 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  35.78 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  33.98 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  33.98 
 
 		 259 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  36.54 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  36.54 
 
 		 239 aa  62  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  33.98 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  33.98 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  36.54 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  37.5 
 
 		 174 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  33.98 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.24 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  33.98 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  33.98 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  38.78 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  34.29 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.39 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  35.58 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  37.25 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  35.59 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  33.53 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  27.08 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  39.39 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  34.75 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  36.52 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  33.88 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  33.98 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  32.8 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  33.98 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  35.35 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  34.69 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  36.59 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  37.76 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  36.27 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  32 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 		 362 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  33.65 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  36.79 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  34.45 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  32.43 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  35.21 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  35.21 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  39.09 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  30.83 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  34.91 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  32.23 
 
 		 327 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  34.09 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  36.27 
 
 		 294 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  32.62 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  33.04 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  36.96 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  28.66 
 
 		 175 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  32.03 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  30.95 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  32.99 
 
 		 175 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  34.04 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  33.93 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  33.04 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  38.38 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  35.24 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  26.52 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  32.65 
 
 		 1160 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>