261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3533 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  41.36 
 
 		 272 aa  135  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  39.91 
 
 		 295 aa  128  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  44.22 
 
 		 306 aa  128  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  39.55 
 
 		 306 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  36.64 
 
 		 296 aa  124  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2657  lytic transglycosylase, catalytic  36.48 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00887082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  44.78 
 
 		 354 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  46.21 
 
 		 372 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  46.21 
 
 		 372 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4954  lytic transglycosylase catalytic  43.29 
 
 		 303 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  44.59 
 
 		 311 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 370 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 378 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 378 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 378 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1661  lytic transglycosylase, catalytic  38.57 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  44.27 
 
 		 355 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  47.01 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  46.21 
 
 		 374 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2043  Lytic transglycosylase catalytic  42.31 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.944666  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  46.21 
 
 		 370 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  46.21 
 
 		 370 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  46.21 
 
 		 370 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  46.21 
 
 		 337 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  46.21 
 
 		 337 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  46.21 
 
 		 367 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  46.21 
 
 		 370 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  46.21 
 
 		 319 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  44.7 
 
 		 398 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  43.66 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  43.94 
 
 		 393 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  43.51 
 
 		 362 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  43.51 
 
 		 395 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  43.51 
 
 		 394 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  43.18 
 
 		 404 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  33.99 
 
 		 330 aa  94.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 321 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  34.38 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  32.52 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  33.87 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  33.33 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  34.51 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  38.38 
 
 		 194 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  35.64 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  35.21 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  30.89 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  29.22 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  29.22 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  29.22 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  39.25 
 
 		 438 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  34.19 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  39.6 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  41.3 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  32.64 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  29.66 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  29.63 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  28.99 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1010  lytic transglycosylase catalytic  32.38 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0664563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  30.48 
 
 		 798 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  28.28 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1794  lytic transglycosylase, catalytic  31.03 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  30.97 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  32.48 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  38.89 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  28.67 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  33.83 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  35.38 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  37.9 
 
 		 296 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  34.21 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  31.78 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  28.67 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  40.45 
 
 		 260 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  37.7 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  35.38 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  31.77 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  28.29 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  43.06 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  28.97 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  40.74 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  37.78 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0244  lytic transglycosylase catalytic  27.66 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  35.71 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  36.17 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  32.59 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  28.49 
 
 		 185 aa  53.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0246  lytic transglycosylase, catalytic  27.27 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 639 aa  52  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  35.63 
 
 		 639 aa  52  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  35.63 
 
 		 639 aa  52  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  37.23 
 
 		 280 aa  52  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  31.78 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  40.7 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  39.19 
 
 		 190 aa  51.6  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 777 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  28.98 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  27.59 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>