208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3105 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  87.97 
 
 		 398 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 393 aa  786    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  72.3 
 
 		 404 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  61.32 
 
 		 367 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  62.91 
 
 		 378 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  62.91 
 
 		 378 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  62.91 
 
 		 378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  61.46 
 
 		 370 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  61.46 
 
 		 370 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  61.96 
 
 		 370 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  61.46 
 
 		 370 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  61.46 
 
 		 370 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  61.31 
 
 		 374 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  60.25 
 
 		 372 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  60.51 
 
 		 372 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  59.89 
 
 		 337 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  59.89 
 
 		 337 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  60.4 
 
 		 319 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  68.86 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  54.98 
 
 		 362 aa  236  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  53.71 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  44.96 
 
 		 354 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  57.77 
 
 		 395 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  61.04 
 
 		 306 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  56.8 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  60.53 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4954  lytic transglycosylase catalytic  54.91 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  51.81 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2657  lytic transglycosylase, catalytic  57.42 
 
 		 267 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00887082  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2043  Lytic transglycosylase catalytic  58.49 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.944666  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1661  lytic transglycosylase, catalytic  58.49 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  53.33 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  55.35 
 
 		 296 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  51.11 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  43.75 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  44.38 
 
 		 321 aa  159  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  43.94 
 
 		 226 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  38.03 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  31.94 
 
 		 208 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 228 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  30.86 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  32.61 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  32.61 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  31.16 
 
 		 217 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  34.69 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  30.86 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  36.49 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  31.78 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  29.51 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  28.87 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  33.78 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  30.51 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  35.65 
 
 		 777 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  31.36 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  30.23 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2210  lytic transglycosylase catalytic  43.16 
 
 		 725 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847947  normal  0.0413346 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  34.21 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  36.54 
 
 		 241 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 223 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  41.11 
 
 		 782 aa  53.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  32.52 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  32.86 
 
 		 168 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 218 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1794  lytic transglycosylase, catalytic  33.61 
 
 		 152 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  39.81 
 
 		 603 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  35.87 
 
 		 833 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  38.55 
 
 		 251 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  30.89 
 
 		 154 aa  50.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  37.18 
 
 		 639 aa  50.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  29.2 
 
 		 280 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  37.18 
 
 		 639 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  37.18 
 
 		 639 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  31.86 
 
 		 226 aa  50.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  37.97 
 
 		 648 aa  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  32.35 
 
 		 185 aa  50.1  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  25.21 
 
 		 239 aa  49.7  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0088  Lytic transglycosylase catalytic  33.94 
 
 		 262 aa  49.7  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  33.65 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  28.67 
 
 		 168 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  24.37 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  43.1 
 
 		 203 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  39.76 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  39.44 
 
 		 261 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  38.37 
 
 		 198 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  39.19 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1010  lytic transglycosylase catalytic  33.05 
 
 		 153 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0664563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1098  Lytic transglycosylase catalytic  25.97 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.891571  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  36.73 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  42.35 
 
 		 209 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  36.71 
 
 		 661 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  35.62 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  30.83 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  30.83 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  30.83 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  30.83 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  32.5 
 
 		 206 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  43.75 
 
 		 190 aa  47  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 233 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>