More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1794 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1794  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 152 aa  308  2e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1010  lytic transglycosylase catalytic  53.29 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0664563  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  48.99 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  48.99 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  35.95 
 
 		 166 aa  84  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  32.92 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  39.42 
 
 		 724 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  48.78 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  39.42 
 
 		 730 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  39.42 
 
 		 730 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  38.98 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  42.31 
 
 		 306 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  39.09 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2657  lytic transglycosylase, catalytic  33.86 
 
 		 267 aa  67.8  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00887082  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  40.48 
 
 		 200 aa  67.4  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  44.19 
 
 		 207 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  42.31 
 
 		 295 aa  67  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  36.11 
 
 		 731 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  38.24 
 
 		 238 aa  67  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  45.12 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  34.19 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1133  lytic transglycosylase catalytic  36.44 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  43.21 
 
 		 717 aa  65.9  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  43.14 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 716 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  39.33 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  37.65 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  40.48 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 438 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  37.61 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 265 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  32.2 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  31.34 
 
 		 603 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2043  Lytic transglycosylase catalytic  41.03 
 
 		 279 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.944666  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  30.43 
 
 		 414 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1661  lytic transglycosylase, catalytic  41.03 
 
 		 279 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  35.53 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 195 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 251 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  38.71 
 
 		 245 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  38.75 
 
 		 272 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  35.9 
 
 		 663 aa  63.5  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  34.17 
 
 		 278 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  39.56 
 
 		 735 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  31.64 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 234 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  36.75 
 
 		 648 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  33.55 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 720 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  33.91 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  33.33 
 
 		 747 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  33.96 
 
 		 729 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  37.08 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  38.2 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  41.3 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  41.25 
 
 		 241 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 296 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 242 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  34.55 
 
 		 260 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  36.21 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  40.74 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  38.54 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  42.35 
 
 		 253 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  32.82 
 
 		 719 aa  61.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.53 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  40.74 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  33.08 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  40.45 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  35.35 
 
 		 336 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  41.89 
 
 		 311 aa  61.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  33.66 
 
 		 242 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  41.46 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 271 aa  60.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  38.64 
 
 		 237 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  35.9 
 
 		 645 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  31.34 
 
 		 209 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  31.34 
 
 		 209 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  33.33 
 
 		 260 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  38.61 
 
 		 657 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  40.91 
 
 		 235 aa  60.5  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  38.61 
 
 		 649 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  33.82 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  43.21 
 
 		 643 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  39.53 
 
 		 593 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  39.53 
 
 		 593 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  38.82 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  30.33 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 677 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  31.34 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  38.61 
 
 		 641 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>