284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2926 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 311 aa  620  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  67.29 
 
 		 306 aa  346  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  53.9 
 
 		 295 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2043  Lytic transglycosylase catalytic  59.83 
 
 		 279 aa  278  8e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.944666  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1661  lytic transglycosylase, catalytic  59.83 
 
 		 279 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2657  lytic transglycosylase, catalytic  57.08 
 
 		 267 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00887082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  54.24 
 
 		 272 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4954  lytic transglycosylase catalytic  55.85 
 
 		 303 aa  275  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  51.66 
 
 		 296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  48.79 
 
 		 306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  52.89 
 
 		 252 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  57.14 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  57.14 
 
 		 337 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  57.14 
 
 		 337 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  54.37 
 
 		 394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  53.11 
 
 		 395 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  62.67 
 
 		 370 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  57.14 
 
 		 370 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  57.14 
 
 		 370 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  57.14 
 
 		 370 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  56.8 
 
 		 393 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  62.67 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  59.01 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  55.43 
 
 		 404 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  58.02 
 
 		 374 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  59.09 
 
 		 378 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  59.09 
 
 		 378 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  59.09 
 
 		 378 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  49.77 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  56.79 
 
 		 370 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  57.69 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  60.13 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  55.62 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  58.44 
 
 		 372 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  43.9 
 
 		 330 aa  145  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  43.64 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  44.9 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  37.6 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  41.58 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  32.52 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  27.32 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  34.42 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  34.04 
 
 		 217 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1794  lytic transglycosylase, catalytic  41.89 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  39.6 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  34.75 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  38.64 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  40.7 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  38.3 
 
 		 194 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  39.78 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  39.53 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  38.14 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  39.6 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  43.68 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  37.62 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  37.62 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  46.75 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  34.13 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  37.86 
 
 		 661 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  43.68 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  34.13 
 
 		 253 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  36.46 
 
 		 245 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  28.5 
 
 		 252 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  36.7 
 
 		 251 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  39 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  29.55 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  39.53 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  35.64 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  44.16 
 
 		 196 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  26.88 
 
 		 228 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  39.33 
 
 		 190 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  39.74 
 
 		 639 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  39.74 
 
 		 639 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  29.29 
 
 		 224 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  39.74 
 
 		 639 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  37 
 
 		 574 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  47.69 
 
 		 297 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  47.69 
 
 		 297 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  29.66 
 
 		 219 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 194 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  30.58 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0088  Lytic transglycosylase catalytic  30.67 
 
 		 262 aa  53.1  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  34.23 
 
 		 438 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  40.7 
 
 		 190 aa  52.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 603 aa  52.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  39.77 
 
 		 258 aa  52.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  36.21 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  34.65 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  38.55 
 
 		 174 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  36.9 
 
 		 191 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 175 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  32.5 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  37.78 
 
 		 175 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  28.39 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  33.91 
 
 		 254 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  35.87 
 
 		 777 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>