More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0744 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 221 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  78.5 
 
 		 218 aa  354  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  77.72 
 
 		 226 aa  308  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  71.15 
 
 		 218 aa  308  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  71.15 
 
 		 218 aa  308  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  79.89 
 
 		 185 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  75.68 
 
 		 219 aa  302  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  77.4 
 
 		 228 aa  289  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  74.43 
 
 		 194 aa  279  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  69.66 
 
 		 206 aa  266  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  63.93 
 
 		 223 aa  260  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  60.82 
 
 		 251 aa  243  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  59.7 
 
 		 241 aa  241  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  57.44 
 
 		 245 aa  223  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  59.66 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  59.66 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  55.11 
 
 		 190 aa  191  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  52.41 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  53.22 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  51.89 
 
 		 210 aa  175  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  43.96 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  47.76 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  39.44 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  44.12 
 
 		 217 aa  72  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  35.78 
 
 		 282 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  37.76 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  38.83 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  40.7 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  27.68 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  38.54 
 
 		 661 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  40.7 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  38.71 
 
 		 671 aa  59.3  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  31.82 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  39.53 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  37.37 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  40.95 
 
 		 663 aa  58.5  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  39.6 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2861  Lytic transglycosylase catalytic  33.57 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  39.53 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  35.51 
 
 		 690 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  36.67 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 		 603 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  36.67 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  33.93 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  36.78 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  36.05 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  36.67 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  38.14 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  44.16 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  36.05 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  36.05 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  36.05 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  41.9 
 
 		 657 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  32.14 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  31.41 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  27.93 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  35.16 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  41.9 
 
 		 657 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  35.71 
 
 		 654 aa  56.2  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  32.31 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  38.14 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  35.51 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  40.43 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  35.56 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  34.78 
 
 		 438 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  26.36 
 
 		 643 aa  55.5  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  30.77 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 660 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  37.21 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 659 aa  55.1  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  40.62 
 
 		 678 aa  55.1  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  35.56 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  32.8 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  42.35 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  34.58 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  34 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  35.63 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 394 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 395 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  33.94 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  32.71 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  36.61 
 
 		 281 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  36.08 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  35.24 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  27.21 
 
 		 354 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  34.41 
 
 		 677 aa  53.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  32.5 
 
 		 643 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  33.02 
 
 		 709 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  40.2 
 
 		 653 aa  53.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  33.02 
 
 		 709 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>