More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5480 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 194 aa  396  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  80.22 
 
 		 218 aa  298  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  80.22 
 
 		 218 aa  298  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  75.68 
 
 		 226 aa  293  9e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  71.81 
 
 		 206 aa  289  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  74.43 
 
 		 221 aa  279  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  71.66 
 
 		 219 aa  277  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  75 
 
 		 228 aa  276  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  73.45 
 
 		 185 aa  275  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  70.56 
 
 		 218 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  68.89 
 
 		 223 aa  261  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  63.1 
 
 		 251 aa  244  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  61.75 
 
 		 253 aa  240  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  61.75 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  61.33 
 
 		 245 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  63.79 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  56.18 
 
 		 190 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  54.75 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  51.04 
 
 		 203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  51.56 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  50.37 
 
 		 190 aa  137  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  47.37 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  47.41 
 
 		 175 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  35.78 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  36.5 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  37.8 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  34.53 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  37.21 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 677 aa  60.5  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  35.4 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  32.43 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  38.3 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  31.53 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  34.34 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  36.05 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  33.1 
 
 		 678 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  33.33 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  33.72 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  33.72 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  35.79 
 
 		 671 aa  57  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  36.46 
 
 		 661 aa  56.6  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  34.69 
 
 		 328 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  30.3 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  36.05 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  31.31 
 
 		 576 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  33.72 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  36.54 
 
 		 603 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  33.72 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  34.58 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  30.3 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  35.65 
 
 		 717 aa  55.8  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  38.71 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  31.2 
 
 		 715 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  33.33 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  33.72 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  33.33 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  32.22 
 
 		 261 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  40.66 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  32.35 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  32.22 
 
 		 261 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  35.29 
 
 		 690 aa  54.7  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  33.33 
 
 		 259 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  34.88 
 
 		 260 aa  54.7  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  30.61 
 
 		 283 aa  54.7  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  26.19 
 
 		 256 aa  54.7  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  29.66 
 
 		 299 aa  54.7  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  37.63 
 
 		 362 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  38.32 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  38.55 
 
 		 152 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  36.17 
 
 		 306 aa  53.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  33.04 
 
 		 326 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  31.36 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  33.64 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 261 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  33.94 
 
 		 659 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  32.76 
 
 		 438 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  30.7 
 
 		 296 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  34.86 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  34.58 
 
 		 655 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  36.63 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  37.21 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  32.97 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2861  Lytic transglycosylase catalytic  33.1 
 
 		 534 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  30.51 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  34.58 
 
 		 655 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  32.69 
 
 		 304 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  34.95 
 
 		 362 aa  52.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  32.65 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  32.69 
 
 		 747 aa  52.4  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  34.02 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  32.56 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  30.7 
 
 		 296 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  29.73 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  32.65 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  30.61 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  33.94 
 
 		 660 aa  52.4  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  32.65 
 
 		 245 aa  52  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  30.33 
 
 		 280 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>