More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0847 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  99.08 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  81.99 
 
 		 226 aa  360  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  74.02 
 
 		 218 aa  319  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  73.49 
 
 		 219 aa  317  7.999999999999999e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  83.24 
 
 		 228 aa  314  8e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  71.15 
 
 		 221 aa  308  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  75.82 
 
 		 185 aa  300  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  80.22 
 
 		 194 aa  298  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  72.13 
 
 		 206 aa  279  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  70.17 
 
 		 223 aa  271  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  61.31 
 
 		 251 aa  244  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  58.33 
 
 		 253 aa  237  8e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  62.01 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  57.49 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  58.62 
 
 		 245 aa  232  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  55.19 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  57.56 
 
 		 221 aa  187  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  52.66 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  51.56 
 
 		 210 aa  179  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  49.25 
 
 		 190 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  48.65 
 
 		 194 aa  124  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  47.41 
 
 		 175 aa  118  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  38.62 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  43.88 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  36.7 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  40.62 
 
 		 661 aa  66.2  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  40 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  34.94 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  36.17 
 
 		 603 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  36.64 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  40.7 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  35.61 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  39.13 
 
 		 241 aa  62  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  32 
 
 		 715 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  37.37 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  37.25 
 
 		 677 aa  60.1  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  37.27 
 
 		 671 aa  60.1  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  34.51 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  35.56 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  39.53 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  36.97 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  34.55 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  38.37 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  37.21 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  37.21 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  35.34 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  30.71 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  33.67 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  37.17 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  36.05 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  36.05 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  36.05 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  37.62 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  36.05 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  37.17 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  40.62 
 
 		 717 aa  57.4  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  39.53 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  26.67 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  30.71 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  35.56 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  36.14 
 
 		 709 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  36.11 
 
 		 690 aa  57  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 659 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  34.78 
 
 		 283 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  36.36 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  35.56 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  38.37 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  35.56 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  35.56 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  36.05 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  34.94 
 
 		 709 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  41.3 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  33.96 
 
 		 747 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  35.56 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 		 663 aa  55.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 660 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 362 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  38.55 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  31.62 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  34.65 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  28.03 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  43.53 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 657 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 657 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  34.69 
 
 		 328 aa  55.1  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  34.31 
 
 		 649 aa  54.7  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  32 
 
 		 649 aa  55.1  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  34.45 
 
 		 261 aa  54.7  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  32.5 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  31.33 
 
 		 256 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>