More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0538 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 194 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  59.63 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  56.52 
 
 		 175 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  50.51 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  52.27 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  53.16 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  46.19 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  46.67 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  54.48 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  52.63 
 
 		 241 aa  144  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  52.63 
 
 		 253 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  52.63 
 
 		 253 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  53.38 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  44.27 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  47.37 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  47.88 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  45.71 
 
 		 219 aa  134  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  46.11 
 
 		 223 aa  134  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  43.5 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  43.5 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  41.29 
 
 		 226 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  45.2 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  51.45 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  43.24 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  44.76 
 
 		 217 aa  84.7  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  47.31 
 
 		 603 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  34.43 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  37.88 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  42.48 
 
 		 304 aa  68.6  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  41.84 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  41.75 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  31.73 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  43.64 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  45.83 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  38.38 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  41.75 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  40.78 
 
 		 260 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  34.68 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  45.56 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  36.54 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  37.76 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  40.43 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  38.6 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  38.94 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  38.54 
 
 		 661 aa  62.4  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  44.71 
 
 		 261 aa  62  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  40.43 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  31.38 
 
 		 362 aa  61.6  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  38.6 
 
 		 782 aa  61.6  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  35.34 
 
 		 649 aa  61.6  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  35.45 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  41.18 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  41.18 
 
 		 261 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  41.18 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  40 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  40 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  35.45 
 
 		 649 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  41.05 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  36.84 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  40 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.59 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  39.8 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  35.64 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  41.49 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  36.56 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  41.75 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  39.77 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  45.36 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 677 aa  59.7  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  38.46 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  32.43 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  40.62 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  38.39 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  32.43 
 
 		 378 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  36.08 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  40 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.04 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  40.18 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  37.89 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  39.22 
 
 		 362 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  41.05 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  30.65 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  43.3 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  37.08 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  43.02 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  43.02 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  36.11 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>