More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0421 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 
190 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  66.67 
 
 
203 aa  251  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  62.37 
 
 
210 aa  249  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  68.05 
 
 
221 aa  248  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  60.66 
 
 
206 aa  214  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  58.95 
 
 
251 aa  214  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  58.92 
 
 
241 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  57.46 
 
 
223 aa  206  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  57.78 
 
 
253 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  57.78 
 
 
253 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  57.3 
 
 
245 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  56.18 
 
 
194 aa  199  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  56.35 
 
 
218 aa  197  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  54.95 
 
 
226 aa  197  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  55.19 
 
 
218 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  55.19 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  56.5 
 
 
185 aa  194  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  56.91 
 
 
219 aa  193  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  55.11 
 
 
221 aa  191  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  54.4 
 
 
228 aa  187  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  52.27 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  56.72 
 
 
190 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  49.28 
 
 
175 aa  140  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  41.48 
 
 
217 aa  89.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  47.37 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  39.81 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  41.84 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  45.68 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  39.53 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  41.41 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  39.8 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  36.76 
 
 
304 aa  65.1  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  41.57 
 
 
260 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  39.02 
 
 
206 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  44.57 
 
 
218 aa  63.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  37.84 
 
 
782 aa  63.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  38 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  37.5 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  32.79 
 
 
325 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  33.85 
 
 
281 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  42.35 
 
 
283 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  33.09 
 
 
649 aa  62.8  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  33.09 
 
 
649 aa  62.8  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  38 
 
 
189 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  40.45 
 
 
260 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 
251 aa  62.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  39.81 
 
 
603 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  39.6 
 
 
261 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  39.81 
 
 
198 aa  62  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  41.98 
 
 
152 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.65 
 
 
226 aa  61.2  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6207  Lytic transglycosylase catalytic  30.46 
 
 
390 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287429  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  37.37 
 
 
263 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  36.19 
 
 
833 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  43.75 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  41.18 
 
 
261 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  41.18 
 
 
261 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  39.39 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  33.91 
 
 
717 aa  60.5  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.59 
 
 
239 aa  59.7  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  41.18 
 
 
261 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  41 
 
 
199 aa  59.3  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  41.18 
 
 
261 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  35.77 
 
 
215 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  38.14 
 
 
280 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  39.8 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  40.91 
 
 
442 aa  59.3  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  38.38 
 
 
299 aa  59.3  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  41.18 
 
 
261 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  41.18 
 
 
261 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  38.54 
 
 
247 aa  58.9  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  37 
 
 
212 aa  58.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 
243 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  34.17 
 
 
201 aa  58.9  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  34.83 
 
 
235 aa  58.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  42.31 
 
 
154 aa  58.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  41.18 
 
 
261 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 
261 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  32.04 
 
 
187 aa  58.5  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  39.47 
 
 
251 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  36.7 
 
 
329 aa  58.2  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  41.18 
 
 
261 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 
234 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  34.19 
 
 
204 aa  58.2  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  39.47 
 
 
251 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
238 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  38.2 
 
 
244 aa  57.8  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  41.11 
 
 
196 aa  57.8  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  35.64 
 
 
661 aa  57.8  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  38.32 
 
 
661 aa  57.8  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  39.47 
 
 
251 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  41.18 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  34.17 
 
 
245 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  39.29 
 
 
390 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  34.15 
 
 
228 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  34.55 
 
 
228 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  35.92 
 
 
715 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  35.56 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2659  Lytic transglycosylase catalytic  33.62 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.725375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  39.58 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>