More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0518 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  100 
 
 		 206 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  71.81 
 
 		 194 aa  289  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  76.5 
 
 		 223 aa  283  9e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  67.16 
 
 		 226 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  72.13 
 
 		 218 aa  279  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  72.13 
 
 		 218 aa  279  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  73.18 
 
 		 185 aa  278  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  72.22 
 
 		 218 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  69.95 
 
 		 219 aa  275  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  69.66 
 
 		 221 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  68.06 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  70.69 
 
 		 228 aa  263  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  67.96 
 
 		 245 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  69.71 
 
 		 241 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  66.85 
 
 		 253 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  66.85 
 
 		 253 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  60.66 
 
 		 190 aa  214  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  57.44 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  57.14 
 
 		 203 aa  193  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  56.57 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  46.74 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  48.15 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  38.46 
 
 		 175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  49.47 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  42.27 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  40.62 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  44.12 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  43.02 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  36.94 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  30.07 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  36.59 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  46.15 
 
 		 603 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  34.34 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  43.56 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  39.39 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  40.7 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  39.39 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  40.7 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  41.76 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  38.46 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  32.67 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  39.25 
 
 		 690 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  34.19 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  38.46 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 663 aa  59.7  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  37.36 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  39.33 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  37.36 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  38.95 
 
 		 671 aa  59.3  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  36.26 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  36.26 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  37.36 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  36.26 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  36.26 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  37.5 
 
 		 661 aa  58.5  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  34.82 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  40.43 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  33.59 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  44.09 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  32.67 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  39.08 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  32.28 
 
 		 280 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  42.22 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  36.96 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  36.78 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  31.86 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  38.37 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  35.35 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  38.68 
 
 		 659 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  34.65 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  34.82 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 664 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  33.62 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  33.01 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  38 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  40.21 
 
 		 678 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  37.11 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  31.53 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  37.4 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  37.25 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  43.81 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  32.74 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  31.3 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  36.79 
 
 		 833 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  35.16 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  34.71 
 
 		 370 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  37.21 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  36.84 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  30.91 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.2 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  39.45 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>