More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3669 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 226 aa  460  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  81.99 
 
 		 218 aa  359  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  81.52 
 
 		 218 aa  357  7e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  73.24 
 
 		 219 aa  320  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  70.09 
 
 		 218 aa  315  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  84.18 
 
 		 228 aa  315  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  77.72 
 
 		 221 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  78.02 
 
 		 185 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  75.27 
 
 		 194 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  71.89 
 
 		 223 aa  285  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  67.16 
 
 		 206 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  65.76 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  64.41 
 
 		 241 aa  237  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  59.34 
 
 		 253 aa  231  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  59.34 
 
 		 253 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  59.56 
 
 		 245 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  54.95 
 
 		 190 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  53.68 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  57.89 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  53.12 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  47.14 
 
 		 190 aa  131  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  50.36 
 
 		 194 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  46.67 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  42.57 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  36.97 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  41.94 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  38.32 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  40.37 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  36.69 
 
 		 603 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  31.67 
 
 		 271 aa  62  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  37.11 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  38.37 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  37.5 
 
 		 661 aa  58.9  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  38.37 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  30.23 
 
 		 329 aa  58.5  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  37.17 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  40.96 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  28.26 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  39.53 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  28.06 
 
 		 299 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  34.88 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  33.62 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  35.35 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  30.34 
 
 		 438 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  35.78 
 
 		 671 aa  56.6  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  32.73 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  34.02 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  38.6 
 
 		 659 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  26.21 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  34.65 
 
 		 690 aa  55.5  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  35.37 
 
 		 709 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  28.17 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  37.5 
 
 		 717 aa  55.1  0.0000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  34.34 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  34.78 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  30.71 
 
 		 328 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  28.17 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  40.62 
 
 		 678 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  28.17 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  28.17 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  35.4 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  32.67 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 499 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  31.75 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  37.62 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  32.73 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  34.91 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  29.59 
 
 		 355 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  35.96 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 		 660 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  32.71 
 
 		 677 aa  53.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  33.03 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  28.68 
 
 		 304 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  31.67 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  29.46 
 
 		 326 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  37.21 
 
 		 442 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  32.56 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  34.15 
 
 		 709 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  32.56 
 
 		 261 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  32.56 
 
 		 261 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  26.52 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  30.84 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  30.61 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  33.72 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  28.95 
 
 		 256 aa  52.8  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  30.15 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  32.41 
 
 		 187 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  29.2 
 
 		 354 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  30 
 
 		 576 aa  52.4  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  32.56 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 		 663 aa  52.4  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  32.56 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 		 657 aa  52.4  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  31.15 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  33.93 
 
 		 281 aa  52.4  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>