More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2937 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  62.79 
 
 		 311 aa  350  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  64.05 
 
 		 295 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  58.72 
 
 		 272 aa  309  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  54.55 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2043  Lytic transglycosylase catalytic  63.18 
 
 		 279 aa  293  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.944666  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1661  lytic transglycosylase, catalytic  63.18 
 
 		 279 aa  292  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2657  lytic transglycosylase, catalytic  58.72 
 
 		 267 aa  291  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00887082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4954  lytic transglycosylase catalytic  57.54 
 
 		 303 aa  279  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  54.1 
 
 		 306 aa  268  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  53.59 
 
 		 252 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  56.72 
 
 		 394 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  59.56 
 
 		 362 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  62.34 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  62.34 
 
 		 337 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  62.34 
 
 		 337 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  61.69 
 
 		 398 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  62.34 
 
 		 370 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  56 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  62.34 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  57.8 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  62.34 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  58.05 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  62.34 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  55.49 
 
 		 404 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  55.76 
 
 		 378 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  55.76 
 
 		 378 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  55.76 
 
 		 378 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  58.72 
 
 		 355 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  58.06 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  57.42 
 
 		 370 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  54.55 
 
 		 372 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  57.42 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  61.54 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  45.62 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  44.58 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  46.9 
 
 		 226 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  40.91 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1794  lytic transglycosylase, catalytic  42.31 
 
 		 152 aa  68.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  37.4 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  31.54 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  42.57 
 
 		 218 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  35.61 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  35.61 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  40.82 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  29.53 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  36 
 
 		 185 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  32.9 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  39.78 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  38.1 
 
 		 639 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  37.17 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  39.6 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  38.1 
 
 		 639 aa  59.3  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  38.1 
 
 		 639 aa  59.3  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  36.19 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  39.6 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  38.46 
 
 		 661 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  29.56 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  29.56 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  37.5 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  37.04 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  30.05 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  37.17 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  36.46 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  34.11 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  36.46 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  37.21 
 
 		 241 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  44.16 
 
 		 198 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  33.33 
 
 		 175 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  41.38 
 
 		 190 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  31.62 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  30.53 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  36.17 
 
 		 194 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  41.38 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  33.06 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  32.81 
 
 		 217 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  37.11 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  36.76 
 
 		 228 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  32.09 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  37.36 
 
 		 234 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  28.86 
 
 		 224 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  37.36 
 
 		 228 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2659  Lytic transglycosylase catalytic  37.36 
 
 		 228 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.725375  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  28.76 
 
 		 252 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  39.33 
 
 		 190 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  64.86 
 
 		 281 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  28.49 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  38 
 
 		 282 aa  53.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  64.86 
 
 		 273 aa  53.1  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  41.38 
 
 		 260 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3765  lytic transglycosylase, catalytic  31.58 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  30.49 
 
 		 217 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  29.68 
 
 		 228 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  64.86 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  32.41 
 
 		 206 aa  52.8  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  29.23 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  33.66 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  31.58 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  35.64 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>