More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2906 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 306 aa  616  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  67.1 
 
 		 296 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  59.57 
 
 		 272 aa  315  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  64.08 
 
 		 295 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1661  lytic transglycosylase, catalytic  63.71 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2043  Lytic transglycosylase catalytic  63.31 
 
 		 279 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.944666  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2657  lytic transglycosylase, catalytic  61.22 
 
 		 267 aa  305  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00887082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4954  lytic transglycosylase catalytic  58.96 
 
 		 303 aa  291  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  57.76 
 
 		 306 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  56.72 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  48.79 
 
 		 311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  45.26 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  45.06 
 
 		 394 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  49.74 
 
 		 362 aa  182  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  54.91 
 
 		 355 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  46.08 
 
 		 404 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  54.34 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  51.11 
 
 		 393 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  52.15 
 
 		 398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  48.96 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  52.73 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  52.73 
 
 		 370 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  52.73 
 
 		 370 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  52.73 
 
 		 370 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  52.73 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  46.35 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  52.73 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  52.73 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  51.5 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  52.73 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  50.3 
 
 		 378 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  50.3 
 
 		 378 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  47.92 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  47.92 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  47.53 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  44.14 
 
 		 226 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  37.44 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  34.18 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  37.4 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  30.69 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  40.86 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  35.77 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  32.88 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  32.88 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  32.54 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  39.09 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  37.27 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  33.85 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  31.49 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  37.23 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1794  lytic transglycosylase, catalytic  37.18 
 
 		 152 aa  58.9  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  46.15 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  38.38 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  32.61 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  32.61 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2659  Lytic transglycosylase catalytic  32.61 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.725375  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  33.33 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  41.56 
 
 		 639 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  41.56 
 
 		 639 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  41.86 
 
 		 198 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  32.69 
 
 		 218 aa  57  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  41.56 
 
 		 639 aa  57  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  47.22 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  31.29 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  39.78 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  35.45 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  36.96 
 
 		 194 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  36.54 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 194 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  33.04 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  35.4 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  37.04 
 
 		 198 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  39.36 
 
 		 281 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  39.29 
 
 		 203 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  37.63 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  40.26 
 
 		 233 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 198 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  40.22 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  36.46 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  34.58 
 
 		 280 aa  53.1  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  36.46 
 
 		 253 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  31.21 
 
 		 191 aa  52.8  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 296 aa  52.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  27.04 
 
 		 388 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  41.25 
 
 		 429 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  37.62 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  38.95 
 
 		 616 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  38.2 
 
 		 190 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 		 199 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  36.94 
 
 		 185 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  43.94 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  31.4 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 234 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 258 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  41.89 
 
 		 202 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3765  lytic transglycosylase, catalytic  42.03 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  38.27 
 
 		 661 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>