More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0832 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  78.5 
 
 		 221 aa  354  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  82.78 
 
 		 185 aa  324  5e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  74.02 
 
 		 218 aa  319  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  74.02 
 
 		 218 aa  319  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  74.63 
 
 		 219 aa  316  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  72.06 
 
 		 226 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  78.29 
 
 		 228 aa  298  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  72.22 
 
 		 206 aa  276  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  70.22 
 
 		 223 aa  275  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  70.56 
 
 		 194 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  64.29 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  65.34 
 
 		 241 aa  248  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  57.56 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  58.33 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  58.54 
 
 		 245 aa  238  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  56.35 
 
 		 190 aa  197  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  52.88 
 
 		 203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  54.6 
 
 		 221 aa  187  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  52.13 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  44.32 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  45.2 
 
 		 194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  42.86 
 
 		 175 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  46.59 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  41.3 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  40.95 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  38.53 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  41.58 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  42.57 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  40.7 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  33.98 
 
 		 271 aa  62  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  31.43 
 
 		 304 aa  62  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  37.78 
 
 		 261 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  37.78 
 
 		 261 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  38.37 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  37.78 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  41.94 
 
 		 603 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  36.43 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  37.21 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  37.21 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  37.21 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  32.06 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  37.78 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  37.21 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  39.53 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  41.46 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  36.67 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  32.74 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  37.21 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  36.67 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  39.53 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  39.53 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  37 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  38 
 
 		 690 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  35.16 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  40.43 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 659 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  32.38 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  40.66 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  37.63 
 
 		 671 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  35.29 
 
 		 661 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  34.02 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  43.01 
 
 		 657 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  41.3 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  43.01 
 
 		 657 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  35.37 
 
 		 709 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  42.7 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 394 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  36.08 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  35.37 
 
 		 709 aa  55.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 395 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  35.05 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  40.21 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  36.73 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  37.78 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  32.17 
 
 		 362 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  35.19 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 378 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  34.31 
 
 		 378 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  34.69 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  37.21 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 378 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  34.31 
 
 		 372 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  39.18 
 
 		 663 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  33.67 
 
 		 654 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  40.86 
 
 		 660 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0307  lytic transglycosylase, catalytic  30.57 
 
 		 332 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  37.62 
 
 		 296 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  37.78 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 372 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  34.21 
 
 		 717 aa  53.9  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  35.71 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  40.22 
 
 		 678 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  33.06 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>