More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2079 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 359 aa  729    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  38.02 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  44.62 
 
 		 429 aa  189  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  39.68 
 
 		 388 aa  165  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  43.45 
 
 		 377 aa  143  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  41.76 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  33.86 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  34.13 
 
 		 376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  32.64 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  35.04 
 
 		 372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  33.33 
 
 		 361 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  33.33 
 
 		 361 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  33.33 
 
 		 361 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  33.33 
 
 		 361 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  33.33 
 
 		 361 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  33.47 
 
 		 360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  33.76 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  33.76 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  33.76 
 
 		 359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  33.76 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  33.76 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  33.76 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  33.76 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  33.76 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  33.47 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  33.05 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  32.49 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  33.05 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  33.05 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  33.05 
 
 		 374 aa  126  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  32.49 
 
 		 358 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  33.93 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  37.79 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  36.63 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  38.95 
 
 		 385 aa  123  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  32.64 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  37.36 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  35.43 
 
 		 519 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  38.51 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  36.02 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  32.71 
 
 		 233 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  34.59 
 
 		 212 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  34.59 
 
 		 220 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  34.59 
 
 		 212 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 203 aa  107  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  35.47 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  36.47 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  33.13 
 
 		 203 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  33.13 
 
 		 203 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  32.73 
 
 		 203 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  33.13 
 
 		 203 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  33.13 
 
 		 203 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  29.87 
 
 		 241 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  29.87 
 
 		 241 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  32.12 
 
 		 203 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  29.44 
 
 		 241 aa  96.3  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4233  lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 215 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  33.91 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  34.55 
 
 		 715 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  26.93 
 
 		 497 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  36.8 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 247 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  32.75 
 
 		 198 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  30.68 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  32.92 
 
 		 663 aa  70.5  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  33.13 
 
 		 748 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0944  lytic transglycosylase, catalytic  34.46 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  33.9 
 
 		 719 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  35.88 
 
 		 688 aa  68.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  33.12 
 
 		 672 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  30.68 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  36.8 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  32.52 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  35.93 
 
 		 603 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1492  lytic transglycosylase, catalytic  35.4 
 
 		 500 aa  68.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.928362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  34.13 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  33.55 
 
 		 673 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  29.63 
 
 		 593 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  29.63 
 
 		 593 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  30.67 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  34.52 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  33.53 
 
 		 190 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  34.52 
 
 		 221 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  31.4 
 
 		 181 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  27.66 
 
 		 258 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 649 aa  66.6  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  33.91 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  34.59 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  33.33 
 
 		 649 aa  66.6  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  35.1 
 
 		 716 aa  66.6  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  33.06 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  31.87 
 
 		 677 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  32.72 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01003  hypothetical protein  25.84 
 
 		 489 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  33.59 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0786  transglycosylase protein  31.45 
 
 		 433 aa  66.2  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  31.9 
 
 		 218 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>