More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03593 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  82.45 
 
 		 375 aa  660    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  92.18 
 
 		 372 aa  721    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 376 aa  780    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  70.29 
 
 		 378 aa  570  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  62.26 
 
 		 373 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  63.73 
 
 		 296 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  47.42 
 
 		 388 aa  352  8e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  46.13 
 
 		 358 aa  345  7e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  49.85 
 
 		 360 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  49.7 
 
 		 374 aa  332  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  46.13 
 
 		 362 aa  332  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  46.13 
 
 		 358 aa  332  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  46.13 
 
 		 358 aa  332  6e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  49.54 
 
 		 359 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  49.7 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  49.24 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  49.24 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  49.24 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  49.24 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  49.24 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  49.24 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  46.4 
 
 		 374 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  48.32 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  49.24 
 
 		 359 aa  330  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  49.54 
 
 		 360 aa  330  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  48.32 
 
 		 359 aa  329  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  48.01 
 
 		 361 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  48.01 
 
 		 361 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  48.01 
 
 		 361 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  48.01 
 
 		 361 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  50.77 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  43.05 
 
 		 363 aa  299  6e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  45.07 
 
 		 377 aa  286  5e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  43.41 
 
 		 340 aa  268  8e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  41.55 
 
 		 349 aa  226  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  41.75 
 
 		 354 aa  222  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  39.1 
 
 		 413 aa  190  4e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  32.4 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  44.12 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  46.25 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  46.25 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  46.25 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  47.83 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  32.53 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  27.75 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  37.83 
 
 		 519 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  34.13 
 
 		 359 aa  133  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  40.61 
 
 		 203 aa  126  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  38.79 
 
 		 203 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  38.79 
 
 		 203 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  38.79 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  38.79 
 
 		 203 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  38.79 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  38.79 
 
 		 203 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  38.79 
 
 		 203 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4233  lytic transglycosylase catalytic  41.1 
 
 		 215 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  38.79 
 
 		 203 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  38.79 
 
 		 241 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  37.65 
 
 		 272 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  39.72 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  40.35 
 
 		 258 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  37.6 
 
 		 196 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  41.88 
 
 		 191 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  35.85 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  39.34 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  35.51 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  37.17 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  34.75 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  38.14 
 
 		 197 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  38.14 
 
 		 218 aa  68.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  40.74 
 
 		 661 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  33.11 
 
 		 499 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  34.51 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  35.15 
 
 		 647 aa  68.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  37.04 
 
 		 263 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 798 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  37.17 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  39.82 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  32.93 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  32.8 
 
 		 198 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  37.72 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  36.8 
 
 		 198 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  37.72 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  37.93 
 
 		 721 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  33.04 
 
 		 197 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  34.75 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  34.19 
 
 		 166 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  34.75 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  31.79 
 
 		 673 aa  64.3  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  31.16 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  34.51 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  30.49 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  36.28 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  26.18 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 645 aa  63.5  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  36.23 
 
 		 782 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>