More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3344 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 394 aa  808    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  50.93 
 
 		 378 aa  335  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  51.7 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  45.79 
 
 		 375 aa  328  9e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  50.77 
 
 		 376 aa  325  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  46.67 
 
 		 373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  48.48 
 
 		 377 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  50.17 
 
 		 296 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  40.48 
 
 		 388 aa  293  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  43.49 
 
 		 358 aa  286  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  43.56 
 
 		 374 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  43.25 
 
 		 374 aa  276  7e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  43.25 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  41.98 
 
 		 362 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  41.98 
 
 		 358 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  42.02 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  41.72 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  42.02 
 
 		 361 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  41.98 
 
 		 358 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  41.72 
 
 		 361 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  41.72 
 
 		 361 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  41.72 
 
 		 361 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  42.02 
 
 		 360 aa  265  8.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  41.41 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  41.41 
 
 		 360 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  41.1 
 
 		 359 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  41.1 
 
 		 360 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  41.1 
 
 		 359 aa  264  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  41.1 
 
 		 359 aa  264  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  41.1 
 
 		 359 aa  264  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  41.1 
 
 		 359 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  41.28 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  42.94 
 
 		 363 aa  260  3e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  40.65 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  43.79 
 
 		 354 aa  229  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  41.89 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  34.04 
 
 		 413 aa  176  9e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  34.97 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  31.21 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  27.55 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 233 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  31.8 
 
 		 378 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  41.76 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  41.36 
 
 		 212 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  41.36 
 
 		 220 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  41.36 
 
 		 212 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  39.18 
 
 		 519 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  38.71 
 
 		 241 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  38.71 
 
 		 241 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  38.71 
 
 		 203 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  38.71 
 
 		 203 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  38.71 
 
 		 203 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  38.71 
 
 		 203 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  38.71 
 
 		 203 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  38.71 
 
 		 241 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  38.71 
 
 		 203 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  39.35 
 
 		 203 aa  113  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  39.66 
 
 		 272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4233  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 215 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 201 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  44.25 
 
 		 649 aa  76.6  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  44.25 
 
 		 649 aa  76.6  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  32.26 
 
 		 673 aa  74.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  31.76 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  35.51 
 
 		 647 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  36.51 
 
 		 197 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  32.03 
 
 		 798 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  34.43 
 
 		 256 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  30.99 
 
 		 166 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  32.5 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  34.75 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  32.9 
 
 		 804 aa  70.9  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  36.44 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  40.37 
 
 		 217 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  31.68 
 
 		 663 aa  68.9  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  34.19 
 
 		 214 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  35.54 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  37.39 
 
 		 574 aa  68.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  38.33 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  29.83 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 661 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  33.56 
 
 		 677 aa  68.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2689  Lytic transglycosylase catalytic  32.14 
 
 		 752 aa  67.8  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  33.12 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  37.23 
 
 		 221 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  36.84 
 
 		 241 aa  67  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  30.46 
 
 		 195 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  27.98 
 
 		 499 aa  66.6  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  30.43 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  39.29 
 
 		 196 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  31.95 
 
 		 715 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  39.09 
 
 		 198 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  29.44 
 
 		 690 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  32.34 
 
 		 637 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  37.82 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  34.92 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  33.85 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  35.2 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>