270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2432 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  99.51 
 
 		 241 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  99.01 
 
 		 203 aa  417  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  99.01 
 
 		 241 aa  417  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  99.51 
 
 		 203 aa  418  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  99.51 
 
 		 241 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  78.33 
 
 		 203 aa  345  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  49.76 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  49.76 
 
 		 220 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  49.76 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  50.47 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4233  lytic transglycosylase catalytic  47.69 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  42.77 
 
 		 374 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  42.77 
 
 		 374 aa  151  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  41.57 
 
 		 360 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  41.57 
 
 		 362 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  41.57 
 
 		 358 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  41.57 
 
 		 358 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  41.01 
 
 		 363 aa  144  9e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  41.57 
 
 		 360 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  41.57 
 
 		 358 aa  141  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  40.36 
 
 		 359 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  40.36 
 
 		 359 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  40.36 
 
 		 360 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  40.36 
 
 		 359 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  40.36 
 
 		 359 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  40.36 
 
 		 359 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  40.36 
 
 		 359 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  40.36 
 
 		 359 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  40.36 
 
 		 359 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  40.36 
 
 		 360 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  39.16 
 
 		 361 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  39.16 
 
 		 361 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  39.16 
 
 		 361 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  39.16 
 
 		 361 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  39.16 
 
 		 361 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  37.2 
 
 		 340 aa  127  1.0000000000000001e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  41.1 
 
 		 378 aa  121  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  39.39 
 
 		 375 aa  121  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  38.79 
 
 		 376 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 		 354 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  38.55 
 
 		 388 aa  118  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  39.02 
 
 		 372 aa  117  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  39.1 
 
 		 377 aa  115  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  38.71 
 
 		 394 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  37.04 
 
 		 349 aa  112  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  35.37 
 
 		 296 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 429 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  37.2 
 
 		 373 aa  105  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  36.42 
 
 		 413 aa  104  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  33.13 
 
 		 359 aa  98.2  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  32.75 
 
 		 519 aa  94.7  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  33.13 
 
 		 272 aa  94.4  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  38.78 
 
 		 385 aa  93.6  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  34.19 
 
 		 378 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  28.92 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  42.39 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  42.86 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  42.53 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  35.24 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  40 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  36.97 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  40.19 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  44 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1319  lytic transglycosylase, catalytic  32.8 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  31.08 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  36.9 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  33.58 
 
 		 649 aa  54.7  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  33.58 
 
 		 649 aa  54.7  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  41.33 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  30.92 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  31.4 
 
 		 256 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 292 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  34.19 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  34.48 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  38.82 
 
 		 663 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  30.91 
 
 		 262 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 603 aa  53.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  37.93 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  36.14 
 
 		 442 aa  52.8  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  31.15 
 
 		 166 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  35.65 
 
 		 290 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 		 175 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  40.91 
 
 		 258 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  37.93 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  36.61 
 
 		 284 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  39.33 
 
 		 154 aa  51.6  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  41.56 
 
 		 281 aa  51.6  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1183  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 		 588 aa  51.6  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  43.66 
 
 		 661 aa  51.6  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  39.33 
 
 		 154 aa  51.2  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 673 aa  50.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  38.89 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>