More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1669 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  100 
 
 		 363 aa  746    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  55.99 
 
 		 374 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  55.99 
 
 		 374 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  54.44 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  54.44 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  54.44 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  54.44 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  56.4 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  56.4 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  56.4 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  56.4 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  54.32 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  56.4 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  53.89 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  54.87 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  54.44 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  56.4 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  55.81 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  55.81 
 
 		 359 aa  388  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  55.81 
 
 		 359 aa  388  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  54.6 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  54.6 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  54.6 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  54.19 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  45.4 
 
 		 340 aa  305  1.0000000000000001e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  46.95 
 
 		 375 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  43.05 
 
 		 376 aa  299  6e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  44.12 
 
 		 378 aa  298  7e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  42.9 
 
 		 372 aa  296  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  45.25 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  47.6 
 
 		 296 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  42.94 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  41.51 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 377 aa  212  5.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  40.85 
 
 		 354 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  37.07 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  48.81 
 
 		 212 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  48.81 
 
 		 220 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  48.81 
 
 		 212 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  50.96 
 
 		 233 aa  173  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  30.58 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  33.59 
 
 		 413 aa  155  9e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  33.58 
 
 		 429 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  44.12 
 
 		 519 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  41.01 
 
 		 203 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  41.01 
 
 		 203 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  41.01 
 
 		 203 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  41.01 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  41.01 
 
 		 203 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  41.01 
 
 		 203 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  41.01 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  41.01 
 
 		 203 aa  143  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  41.01 
 
 		 241 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  31.64 
 
 		 427 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  41.82 
 
 		 203 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  29.63 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4233  lytic transglycosylase catalytic  45.22 
 
 		 215 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  37.36 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  34.57 
 
 		 272 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  36.17 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  32.65 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  35.14 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  31.11 
 
 		 280 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 191 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  40.54 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  39.82 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  37.84 
 
 		 649 aa  73.6  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  38.79 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  37.84 
 
 		 649 aa  73.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  36.81 
 
 		 661 aa  72.8  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  37.07 
 
 		 223 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  32.21 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  29.41 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  29.65 
 
 		 499 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  38.71 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  34.96 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  40.35 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  35.66 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  35.66 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  29.95 
 
 		 166 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  36.13 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  32.09 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  39.2 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  36.51 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  35.94 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 		 464 aa  67  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  38.39 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  38.94 
 
 		 647 aa  67.4  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  31.76 
 
 		 194 aa  67  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  38.53 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  38.79 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  34.82 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  33.62 
 
 		 477 aa  66.2  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>