More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0901 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  100 
 
 		 340 aa  699    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  52.86 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.7 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.04 
 
 		 657 aa  106  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  40.29 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  40.46 
 
 		 591 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  40.44 
 
 		 269 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  40.44 
 
 		 269 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  40.65 
 
 		 262 aa  97.1  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  37.5 
 
 		 269 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  40.58 
 
 		 269 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  33.51 
 
 		 266 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  38.24 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  38.57 
 
 		 452 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  35.33 
 
 		 259 aa  90.5  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  32.63 
 
 		 267 aa  90.5  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  38.85 
 
 		 182 aa  89.7  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  35.94 
 
 		 262 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  37.41 
 
 		 481 aa  86.3  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  34.94 
 
 		 282 aa  85.9  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  37.4 
 
 		 603 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  27.23 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  35.51 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  34.73 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  41.28 
 
 		 653 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 680 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  41.28 
 
 		 677 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  39.62 
 
 		 677 aa  79.7  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  33.09 
 
 		 664 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  27.63 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0593  copper amine oxidase-like protein  35 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  43.75 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  37.84 
 
 		 535 aa  77  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  31.54 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  41.28 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  35.66 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  34.23 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  36.13 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  37.62 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  39.09 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  37.07 
 
 		 495 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  36.22 
 
 		 244 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  33.09 
 
 		 206 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  38.74 
 
 		 680 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  40.71 
 
 		 113 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  32.33 
 
 		 672 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  43.24 
 
 		 655 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  32.08 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  26.27 
 
 		 682 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  30.88 
 
 		 774 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  30.88 
 
 		 774 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  37.27 
 
 		 649 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.85 
 
 		 669 aa  70.5  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  36.7 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1597  soluble lytic murein transglycosylase precursor  44.71 
 
 		 651 aa  70.5  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  35.45 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  36.29 
 
 		 716 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  30.88 
 
 		 776 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  35.38 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  38.24 
 
 		 756 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  35.64 
 
 		 677 aa  70.1  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  29.81 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  39.32 
 
 		 616 aa  69.3  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  38.39 
 
 		 529 aa  69.3  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  37.76 
 
 		 182 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  39.29 
 
 		 748 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  31.82 
 
 		 207 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 		 804 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  35.11 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 726 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  37.27 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  31.58 
 
 		 690 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  37 
 
 		 721 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  34 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 663 aa  67.4  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  38.52 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  31.01 
 
 		 383 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  31.51 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  32.19 
 
 		 758 aa  67  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  38.04 
 
 		 719 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  31.29 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  30.36 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  36.63 
 
 		 691 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  37.86 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  33.66 
 
 		 760 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  37.07 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  28.49 
 
 		 478 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  33.33 
 
 		 652 aa  65.9  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  37.11 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  29.74 
 
 		 354 aa  65.9  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  33.66 
 
 		 757 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 685 aa  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  25.5 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 746 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  34.91 
 
 		 649 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  35.58 
 
 		 645 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>