138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1827 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  100 
 
 
323 aa  659    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  59.72 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  59.03 
 
 
269 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  59.72 
 
 
269 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  55.48 
 
 
262 aa  179  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  56.25 
 
 
269 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  52.53 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  51.9 
 
 
266 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  54.74 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.39 
 
 
657 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.85 
 
 
431 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  45.32 
 
 
591 aa  123  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  42.57 
 
 
182 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  42.77 
 
 
452 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  38.69 
 
 
291 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  38.22 
 
 
481 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  44.37 
 
 
282 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  40.56 
 
 
276 aa  99.4  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  44.25 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  42.19 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  41.59 
 
 
535 aa  96.3  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.56 
 
 
657 aa  95.9  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  32.09 
 
 
259 aa  94  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.54 
 
 
907 aa  93.2  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  43.36 
 
 
426 aa  92.8  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  46.43 
 
 
113 aa  92.4  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  38.24 
 
 
340 aa  91.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  45.61 
 
 
216 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  42.11 
 
 
529 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  35.97 
 
 
451 aa  89.7  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  40 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  37.11 
 
 
383 aa  88.6  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0593  copper amine oxidase-like protein  29.9 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  38.06 
 
 
483 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  45.9 
 
 
304 aa  87.4  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  41.59 
 
 
495 aa  87  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  33.99 
 
 
450 aa  86.3  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  37.32 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  37.82 
 
 
553 aa  83.2  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  37.96 
 
 
456 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  34.51 
 
 
418 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  30.77 
 
 
948 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  39.81 
 
 
625 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  36.84 
 
 
1176 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  37.04 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  38.4 
 
 
478 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  37.89 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  41.88 
 
 
758 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  43.22 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  41.9 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2097  copper amine oxidase domain protein  29.87 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.440325  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  36.75 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  40.71 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  36.46 
 
 
763 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  34.31 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  38.18 
 
 
650 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  41.3 
 
 
845 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  28.38 
 
 
502 aa  76.6  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  34.71 
 
 
541 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  25.31 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  38.83 
 
 
741 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  38.14 
 
 
480 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  27.96 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  39.56 
 
 
514 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  37.96 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  37.19 
 
 
732 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  36.28 
 
 
792 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  34.78 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4080  copper amine oxidase domain protein  39.36 
 
 
501 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  28.97 
 
 
454 aa  73.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  36.21 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  31.03 
 
 
447 aa  72.8  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  34.23 
 
 
249 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
704 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  34.95 
 
 
652 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  34.15 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2591  copper amine oxidase domain protein  32.12 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.066327  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0140  hypothetical protein  33.85 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0861  copper amine oxidase domain protein  29.8 
 
 
574 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  33.13 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  31.36 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  29.41 
 
 
153 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1644  copper amine oxidase domain-containing protein  36.81 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  38.94 
 
 
547 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3230  copper amine oxidase domain protein  29.88 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.41019  normal  0.147437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  37.5 
 
 
781 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1215  copper amine oxidase domain-containing protein  35.58 
 
 
784 aa  67  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  32.52 
 
 
763 aa  66.6  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  31.58 
 
 
549 aa  66.2  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  27.22 
 
 
934 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0382  copper amine oxidase-like protein  29.56 
 
 
403 aa  65.1  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2153  copper amine oxidase domain protein  36.79 
 
 
1118 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0231006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  35.9 
 
 
458 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2648  copper amine oxidase domain protein  40.96 
 
 
620 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  33.96 
 
 
343 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2494  copper amine oxidase domain protein  34.78 
 
 
784 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0315716  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0044  copper amine oxidase domain protein  38.46 
 
 
754 aa  63.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00564883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  29.27 
 
 
143 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  30.77 
 
 
429 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1858  copper amine oxidase domain protein  33.72 
 
 
229 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.164538 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>