142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0048 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  100 
 
 
269 aa  545  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  91.82 
 
 
269 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  83.64 
 
 
269 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  77.7 
 
 
269 aa  431  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  78.24 
 
 
262 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  55.82 
 
 
262 aa  275  7e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  53.6 
 
 
267 aa  260  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  53.2 
 
 
266 aa  259  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  59.72 
 
 
323 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  44.29 
 
 
591 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.14 
 
 
431 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.41 
 
 
657 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  42.74 
 
 
535 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  34.57 
 
 
182 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.92 
 
 
657 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  39.87 
 
 
259 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  40.44 
 
 
340 aa  99  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  42.86 
 
 
481 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.78 
 
 
907 aa  97.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  40.28 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  38.67 
 
 
452 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  43.97 
 
 
495 aa  96.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  40.71 
 
 
281 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  41.96 
 
 
113 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  41.23 
 
 
251 aa  87  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  30.77 
 
 
450 aa  86.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  36.62 
 
 
418 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  41.07 
 
 
529 aa  85.5  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  44.23 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  35.46 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  36.23 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  34.62 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  40.21 
 
 
553 aa  83.2  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  44.23 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  32.89 
 
 
483 aa  81.6  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  38.94 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  39.64 
 
 
792 aa  82  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  36.72 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  44.34 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  33.6 
 
 
447 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  40.52 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  31.08 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  37.39 
 
 
474 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  37.39 
 
 
478 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  31.94 
 
 
414 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1858  copper amine oxidase domain protein  32.85 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.164538 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  40.19 
 
 
650 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0593  copper amine oxidase-like protein  25 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  32.89 
 
 
451 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  37.84 
 
 
763 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  39.05 
 
 
216 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  39.45 
 
 
175 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  38.94 
 
 
1176 aa  73.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  30.14 
 
 
502 aa  73.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  28.28 
 
 
418 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  43.14 
 
 
948 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  36.94 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  36.04 
 
 
426 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  33.93 
 
 
652 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  38 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  39.78 
 
 
480 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  33.82 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  35.04 
 
 
429 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  35.04 
 
 
541 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4080  copper amine oxidase domain protein  35.96 
 
 
501 aa  69.3  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  35.58 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  31.5 
 
 
343 aa  68.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  39.81 
 
 
465 aa  68.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  36.84 
 
 
176 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  32.46 
 
 
704 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  36.44 
 
 
758 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  25.67 
 
 
554 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  38 
 
 
732 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  34.04 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  34.78 
 
 
741 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  38.54 
 
 
547 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  32.43 
 
 
763 aa  66.2  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3230  copper amine oxidase domain protein  27.27 
 
 
299 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.41019  normal  0.147437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  37.17 
 
 
781 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2591  copper amine oxidase domain protein  30.07 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.066327  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  29.66 
 
 
625 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  33.9 
 
 
331 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 
153 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2097  copper amine oxidase domain protein  28.1 
 
 
258 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.440325  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  31 
 
 
514 aa  62.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  30.91 
 
 
521 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2494  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 
784 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0315716  normal 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2153  copper amine oxidase domain protein  32.08 
 
 
1118 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0231006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  30.53 
 
 
845 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  27.88 
 
 
549 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  34.19 
 
 
458 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  31.03 
 
 
423 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  33.61 
 
 
421 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0861  copper amine oxidase domain protein  28.17 
 
 
574 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2343  copper amine oxidase-like  33.33 
 
 
751 aa  59.3  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  28.32 
 
 
143 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0754  copper amine oxidase domain protein  29.09 
 
 
589 aa  58.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  35.71 
 
 
718 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  30.68 
 
 
454 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0140  hypothetical protein  35.16 
 
 
372 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>