156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0824 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  100 
 
 
591 aa  1192    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  31.34 
 
 
269 aa  123  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  41.24 
 
 
262 aa  123  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  45.32 
 
 
323 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  43.71 
 
 
267 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  43.71 
 
 
266 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  33.33 
 
 
269 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  40.62 
 
 
182 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  39.18 
 
 
269 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  44.29 
 
 
269 aa  117  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.42 
 
 
657 aa  117  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  44.12 
 
 
262 aa  115  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  40.67 
 
 
481 aa  110  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.45 
 
 
657 aa  108  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  47.37 
 
 
495 aa  108  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  48.33 
 
 
535 aa  107  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.59 
 
 
431 aa  104  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  39.63 
 
 
259 aa  103  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  29.68 
 
 
483 aa  103  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  41.23 
 
 
291 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  45.08 
 
 
478 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  42.18 
 
 
276 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  40.46 
 
 
340 aa  100  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  38.85 
 
 
452 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.83 
 
 
907 aa  96.3  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  41.8 
 
 
529 aa  95.1  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  34.27 
 
 
426 aa  94.7  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  37.59 
 
 
298 aa  93.2  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  35.66 
 
 
450 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  37.3 
 
 
323 aa  92.8  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  33.14 
 
 
502 aa  91.7  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  40.14 
 
 
216 aa  90.1  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  35.85 
 
 
383 aa  90.1  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  44.44 
 
 
263 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  40.15 
 
 
282 aa  89.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  33.11 
 
 
281 aa  89  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  36.52 
 
 
553 aa  89.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  44.12 
 
 
650 aa  88.6  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  36.36 
 
 
423 aa  87.8  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  45.36 
 
 
732 aa  87.4  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  36.05 
 
 
451 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  43.24 
 
 
292 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  31.19 
 
 
418 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  37.1 
 
 
251 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  42.2 
 
 
175 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  34.48 
 
 
414 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  40.37 
 
 
480 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0593  copper amine oxidase-like protein  38.52 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  40.8 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  32.59 
 
 
763 aa  80.1  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  30.81 
 
 
451 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  35.92 
 
 
514 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  45.05 
 
 
113 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  42.22 
 
 
845 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  34.15 
 
 
1176 aa  77  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2591  copper amine oxidase domain protein  32.84 
 
 
298 aa  77  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.066327  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  40.62 
 
 
950 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0436  copper amine oxidase domain-containing protein  29.7 
 
 
471 aa  77  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  39.58 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  33.12 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4153  copper amine oxidase domain protein  34.45 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  hitchhiker  0.0000000469459 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  37.11 
 
 
1305 aa  75.1  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  39.42 
 
 
176 aa  75.1  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  32.67 
 
 
948 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  33.98 
 
 
474 aa  73.9  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  34.06 
 
 
456 aa  73.9  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1858  copper amine oxidase domain protein  34.41 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.164538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  35.85 
 
 
781 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  35.09 
 
 
541 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3230  copper amine oxidase domain protein  30.63 
 
 
299 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.41019  normal  0.147437 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  39.33 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  35.09 
 
 
792 aa  71.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  32.41 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2097  copper amine oxidase domain protein  32.58 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.440325  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  31.71 
 
 
763 aa  70.5  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  30.89 
 
 
214 aa  69.7  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  32 
 
 
331 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  32.34 
 
 
718 aa  70.1  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  27.61 
 
 
554 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  34 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  34.75 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  32.04 
 
 
741 aa  67.8  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  36.21 
 
 
758 aa  67.4  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 
372 aa  67  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  30.3 
 
 
343 aa  67  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  30.95 
 
 
521 aa  67  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  30.28 
 
 
625 aa  67  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  31.43 
 
 
429 aa  67  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  32.48 
 
 
458 aa  67  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4080  copper amine oxidase domain protein  38.2 
 
 
501 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  30.83 
 
 
352 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  34.62 
 
 
153 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1234  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.96 
 
 
437 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1644  copper amine oxidase domain-containing protein  31.98 
 
 
446 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0501  copper amine oxidase domain protein  30.06 
 
 
487 aa  65.5  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2153  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 
1118 aa  65.1  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0231006  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0382  copper amine oxidase-like protein  30.52 
 
 
403 aa  65.1  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  30.83 
 
 
320 aa  64.3  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  28.93 
 
 
549 aa  64.3  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 
465 aa  63.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>