127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1778 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  100 
 
 		 319 aa  646    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  28.42 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  32.51 
 
 		 732 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  32.21 
 
 		 529 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  33.12 
 
 		 591 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  28.22 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  31.28 
 
 		 741 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  29.69 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  31.03 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  26.8 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2648  copper amine oxidase domain protein  28.02 
 
 		 620 aa  69.7  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  51.72 
 
 		 792 aa  69.3  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  31.97 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.95 
 
 		 657 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  28.04 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  37.21 
 
 		 535 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  26.56 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  30.86 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  29.45 
 
 		 763 aa  67  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.62 
 
 		 657 aa  66.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  33.55 
 
 		 1305 aa  66.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1643  copper amine oxidase domain protein  27.78 
 
 		 763 aa  66.2  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00153148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  27.4 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  27.59 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  27.27 
 
 		 758 aa  65.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  30.46 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  29.47 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  27.27 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  29.38 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  29.26 
 
 		 650 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  24.45 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  27.08 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  30.87 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  27.36 
 
 		 182 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  26.07 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  30.57 
 
 		 845 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  31.08 
 
 		 113 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  33.56 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  33.56 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1215  copper amine oxidase domain-containing protein  27.52 
 
 		 784 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  25.61 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  27.22 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  29.38 
 
 		 1176 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2343  copper amine oxidase-like  30.41 
 
 		 751 aa  60.5  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  30.06 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  25.93 
 
 		 704 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0501  copper amine oxidase domain protein  22.7 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.51 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  21.79 
 
 		 549 aa  59.3  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  31.08 
 
 		 948 aa  59.3  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  32.89 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  27.16 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  27.87 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  27.96 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  26.92 
 
 		 781 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  22.84 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  25.44 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0593  copper amine oxidase-like protein  30.82 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  28.68 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  24.76 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2494  copper amine oxidase domain protein  40.68 
 
 		 784 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0315716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2654  hypothetical protein  31.4 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0939  copper amine oxidase domain-containing protein  30.27 
 
 		 329 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  27.92 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  30.41 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3142  copper amine oxidase domain-containing protein  31.14 
 
 		 746 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  31.82 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  30.2 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  29.53 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  27.03 
 
 		 553 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  27.27 
 
 		 458 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  28.57 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  23.66 
 
 		 625 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4153  copper amine oxidase domain protein  27.15 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  hitchhiker  0.0000000469459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  31.82 
 
 		 269 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  30.43 
 
 		 950 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  26.43 
 
 		 541 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0754  copper amine oxidase domain protein  25 
 
 		 589 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  25.81 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0382  copper amine oxidase-like protein  28.99 
 
 		 403 aa  53.9  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  31.65 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2153  copper amine oxidase domain protein  22.5 
 
 		 1118 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0231006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  28.02 
 
 		 521 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  22.86 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.56 
 
 		 907 aa  53.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  28.08 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  29.2 
 
 		 480 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0546  copper amine oxidase domain protein  24.83 
 
 		 749 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2591  copper amine oxidase domain protein  35.82 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.066327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 		 372 aa  53.1  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  27.74 
 
 		 460 aa  53.1  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  30 
 
 		 451 aa  53.1  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  26.59 
 
 		 304 aa  52.8  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  28.46 
 
 		 514 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0140  hypothetical protein  25.93 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  24.65 
 
 		 474 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0367  copper amine oxidase domain protein  42.31 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024896 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  28.77 
 
 		 423 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  25.91 
 
 		 718 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  24.4 
 
 		 450 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>