129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0133 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  100 
 
 
741 aa  1482    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2153  copper amine oxidase domain protein  35.96 
 
 
1118 aa  326  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0231006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0044  copper amine oxidase domain protein  33.98 
 
 
754 aa  323  8e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00564883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  32.32 
 
 
781 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2343  copper amine oxidase-like  34.57 
 
 
751 aa  285  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  32.37 
 
 
704 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1643  copper amine oxidase domain protein  29.22 
 
 
763 aa  213  7e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00153148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3142  copper amine oxidase domain-containing protein  30.5 
 
 
746 aa  212  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0546  copper amine oxidase domain protein  39.38 
 
 
749 aa  156  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  24.25 
 
 
758 aa  153  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1215  copper amine oxidase domain-containing protein  42.7 
 
 
784 aa  153  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  51.67 
 
 
414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  44.63 
 
 
549 aa  128  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  45.24 
 
 
450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  47.5 
 
 
429 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  42.96 
 
 
383 aa  117  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4153  copper amine oxidase domain protein  42.15 
 
 
366 aa  111  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  hitchhiker  0.0000000469459 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  43.9 
 
 
625 aa  109  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0754  copper amine oxidase domain protein  41.67 
 
 
589 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  40.8 
 
 
458 aa  106  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  34.31 
 
 
474 aa  104  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  43.41 
 
 
289 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  41.18 
 
 
320 aa  100  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  41.32 
 
 
652 aa  99.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  33.09 
 
 
153 aa  98.2  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  36.22 
 
 
447 aa  96.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  37.61 
 
 
176 aa  95.1  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  41.82 
 
 
282 aa  94.7  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  42.48 
 
 
259 aa  94.7  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  45.45 
 
 
495 aa  94  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  41.59 
 
 
452 aa  92  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  37.67 
 
 
421 aa  91.3  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  37.93 
 
 
263 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  37.5 
 
 
792 aa  88.2  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  36.3 
 
 
732 aa  87.8  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2494  copper amine oxidase domain protein  34.17 
 
 
784 aa  87.4  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0315716  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0140  hypothetical protein  36.89 
 
 
372 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  40.74 
 
 
216 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  41.35 
 
 
113 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  38.18 
 
 
426 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  36.97 
 
 
450 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  38.53 
 
 
175 aa  84.7  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  38.06 
 
 
298 aa  84  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.64 
 
 
907 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  37.93 
 
 
845 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  34.45 
 
 
763 aa  82.4  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  34.55 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  44.76 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  40.78 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0939  copper amine oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 
329 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  36.94 
 
 
483 aa  80.5  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  39.25 
 
 
1176 aa  79.7  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0501  copper amine oxidase domain protein  32.39 
 
 
487 aa  79  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  36.61 
 
 
478 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.14 
 
 
657 aa  76.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  38.83 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.5 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  37.89 
 
 
950 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  38.32 
 
 
529 aa  74.3  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.54 
 
 
657 aa  74.3  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  31.28 
 
 
319 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4080  copper amine oxidase domain protein  35 
 
 
501 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  34.55 
 
 
650 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  29.08 
 
 
456 aa  72.4  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  32.69 
 
 
514 aa  71.6  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  31.18 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  36.67 
 
 
480 aa  71.6  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  33.98 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  31.37 
 
 
521 aa  71.2  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  35.92 
 
 
281 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  36.89 
 
 
267 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  36.89 
 
 
266 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  33.02 
 
 
1305 aa  69.3  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  36.89 
 
 
262 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  34.31 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  32.76 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  36.27 
 
 
541 aa  68.2  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  35.71 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  32.04 
 
 
591 aa  67.4  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  35.71 
 
 
269 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  31.37 
 
 
948 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2788  copper amine oxidase domain-containing protein  38.89 
 
 
270 aa  67.4  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  31.36 
 
 
423 aa  67  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  29.71 
 
 
451 aa  66.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  31.53 
 
 
143 aa  65.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1858  copper amine oxidase domain protein  34.86 
 
 
229 aa  65.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.164538 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  32.71 
 
 
298 aa  65.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  34.95 
 
 
262 aa  65.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  31.82 
 
 
352 aa  65.1  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  33.98 
 
 
269 aa  65.1  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  35.71 
 
 
553 aa  64.7  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  31.73 
 
 
214 aa  63.5  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.55 
 
 
411 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000751939 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 
481 aa  62.4  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  30.08 
 
 
249 aa  62  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  30 
 
 
323 aa  62  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  31.37 
 
 
535 aa  61.6  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  33.01 
 
 
460 aa  61.6  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  32.11 
 
 
182 aa  61.2  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  27.93 
 
 
292 aa  60.8  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>