230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1871 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  100 
 
 
451 aa  928    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  32.67 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  35.79 
 
 
316 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  35.81 
 
 
349 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  34.8 
 
 
426 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  32.39 
 
 
384 aa  159  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  36.03 
 
 
420 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.42 
 
 
433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  27.29 
 
 
521 aa  153  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  31.34 
 
 
358 aa  145  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  34.19 
 
 
428 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  32.35 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  32.35 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  32.35 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  32.35 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  31.93 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  31.93 
 
 
430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  32.35 
 
 
430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  32.35 
 
 
430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  32.35 
 
 
430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 
418 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  34.19 
 
 
307 aa  137  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 
428 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  28.57 
 
 
415 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  30.9 
 
 
430 aa  133  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 
426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  29.22 
 
 
427 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  31.9 
 
 
426 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 
793 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  33.74 
 
 
470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  29.86 
 
 
423 aa  128  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  27.39 
 
 
418 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  27.85 
 
 
418 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  32.74 
 
 
312 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  28.33 
 
 
503 aa  121  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  25.69 
 
 
426 aa  121  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.9 
 
 
1115 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  28.4 
 
 
688 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.44 
 
 
1115 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 
430 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  27.73 
 
 
390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  26.81 
 
 
1119 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.05 
 
 
1115 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  25.15 
 
 
1115 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  33.62 
 
 
542 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  28.63 
 
 
647 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  25.76 
 
 
927 aa  97.4  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  28.16 
 
 
579 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  31.08 
 
 
484 aa  95.9  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  29.96 
 
 
567 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 
329 aa  94.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.68 
 
 
1101 aa  94  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.55 
 
 
1124 aa  93.6  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  26.2 
 
 
343 aa  92.8  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 
356 aa  91.3  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  27.42 
 
 
356 aa  90.5  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  35.97 
 
 
323 aa  89.7  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  30.63 
 
 
948 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  31.47 
 
 
452 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  36.05 
 
 
591 aa  86.3  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  34.46 
 
 
276 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  24.15 
 
 
1118 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  32.85 
 
 
282 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  27.63 
 
 
444 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  36.04 
 
 
175 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 
583 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  34.07 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  31.71 
 
 
483 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  34.87 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  36.81 
 
 
481 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  42.11 
 
 
535 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  31.08 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  32.21 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  31.08 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  32.12 
 
 
262 aa  77  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  41.51 
 
 
113 aa  77  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  26.01 
 
 
587 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  30.41 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  29.29 
 
 
451 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  22.84 
 
 
1154 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.97 
 
 
907 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  34.78 
 
 
450 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  34.31 
 
 
1176 aa  74.3  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  30.43 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  27.61 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  28.15 
 
 
502 aa  73.2  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.56 
 
 
657 aa  73.2  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  34.48 
 
 
763 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  31.16 
 
 
342 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  30.82 
 
 
266 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  33.65 
 
 
625 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  38.24 
 
 
251 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  30.17 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  34.62 
 
 
732 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  28.47 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  34.68 
 
 
478 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  31.69 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  39.77 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  41.05 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  31.3 
 
 
792 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>