292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0017 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  85.05 
 
 		 428 aa  777    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 		 428 aa  880    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  55.71 
 
 		 430 aa  500  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  53.85 
 
 		 430 aa  485  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  54.08 
 
 		 430 aa  487  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  53.85 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  53.38 
 
 		 430 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  53.61 
 
 		 430 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  53.38 
 
 		 430 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  53.61 
 
 		 430 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  53.38 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  53.38 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.16 
 
 		 470 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  44.55 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  49.69 
 
 		 342 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  41.21 
 
 		 390 aa  299  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  37.91 
 
 		 423 aa  287  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  36.7 
 
 		 430 aa  276  4e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  35.66 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  33.33 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  26.84 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  30.48 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.85 
 
 		 433 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  28.98 
 
 		 349 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  26.96 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  30.26 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  29.15 
 
 		 312 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  33.33 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  30.22 
 
 		 793 aa  123  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  24.65 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  25.42 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  24.92 
 
 		 358 aa  113  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24 
 
 		 1115 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  28.84 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.08 
 
 		 1115 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.2 
 
 		 1115 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  22.93 
 
 		 1119 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  24.92 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  22.67 
 
 		 1115 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  28.23 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  29.22 
 
 		 688 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  24.76 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  27.96 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  26.71 
 
 		 542 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  28.39 
 
 		 647 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  23.65 
 
 		 927 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  25.21 
 
 		 567 aa  87.8  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  23.6 
 
 		 579 aa  86.3  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 		 1124 aa  81.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  22.18 
 
 		 583 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.78 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  38.14 
 
 		 274 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 1154 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  31.94 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  26.57 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3919  chitinase II  24.9 
 
 		 695 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00105192  normal  0.0100672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  24.05 
 
 		 1118 aa  73.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  28.18 
 
 		 301 aa  72.8  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  40.21 
 
 		 405 aa  73.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  36.3 
 
 		 620 aa  70.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  34.55 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  24.02 
 
 		 521 aa  70.5  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  23.89 
 
 		 1101 aa  70.5  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  30.95 
 
 		 287 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  38 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  24.9 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  40.62 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  35.16 
 
 		 1001 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 		 1079 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  34.23 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  38.68 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  35.05 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  35.16 
 
 		 1021 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  21.65 
 
 		 587 aa  63.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 301 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  32.41 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  33.66 
 
 		 173 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  31.85 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  29.73 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0336  peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.230507  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03621  LysM domain-containing protein  32.41 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.624755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  27.03 
 
 		 872 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2210  hypothetical protein  24.12 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.179103  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  32.76 
 
 		 568 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  27.87 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  30.63 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.1 
 
 		 617 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  36.19 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  30.11 
 
 		 1556 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  27.14 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  34.26 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  30.63 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  31.43 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.62 
 
 		 527 aa  57.4  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.05 
 
 		 554 aa  57  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>