43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2210 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2210  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  737    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.179103  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  27.78 
 
 		 503 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  26.81 
 
 		 647 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  25.91 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  23.24 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  26.84 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  25.91 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  23.58 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  22.65 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  24.07 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  21.89 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  23.01 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  26.94 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  26.94 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  26.94 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  21.66 
 
 		 793 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  26.94 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  26.03 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  26.94 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  24.12 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  21.14 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  26.03 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  26.94 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  24.89 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.82 
 
 		 1124 aa  59.3  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  24.17 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.13 
 
 		 1115 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.13 
 
 		 1115 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  20.96 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  21.43 
 
 		 420 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  22.52 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  22.67 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  21.36 
 
 		 1115 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  21.36 
 
 		 1115 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  21.36 
 
 		 1119 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  20.43 
 
 		 430 aa  47.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  25.23 
 
 		 470 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  21.2 
 
 		 927 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  20 
 
 		 1118 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  22.75 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 1101 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>