More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1800 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 503 aa  1021    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  31.31 
 
 		 384 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  32.17 
 
 		 420 aa  180  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  28.45 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  28.01 
 
 		 430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.72 
 
 		 470 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  28.01 
 
 		 430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  28.01 
 
 		 430 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  28.01 
 
 		 430 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  28.01 
 
 		 430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  28.01 
 
 		 430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  27.57 
 
 		 430 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  27.57 
 
 		 430 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 		 349 aa  163  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  30.75 
 
 		 793 aa  162  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  26.84 
 
 		 428 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  27.69 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  30.9 
 
 		 316 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  32.03 
 
 		 307 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  27.49 
 
 		 428 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  27.13 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  30.32 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  26.82 
 
 		 374 aa  144  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  29.08 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.9 
 
 		 1115 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  27.44 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.36 
 
 		 1115 aa  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  26.08 
 
 		 430 aa  133  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  27.44 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.36 
 
 		 1115 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  28.73 
 
 		 1119 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  28.36 
 
 		 1115 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 		 418 aa  123  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  29.71 
 
 		 647 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.21 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  26.86 
 
 		 358 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  28.33 
 
 		 451 aa  121  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  27.9 
 
 		 927 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  26.83 
 
 		 415 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  27.96 
 
 		 426 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 1154 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  24.33 
 
 		 423 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  25.27 
 
 		 1124 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  55.1 
 
 		 546 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24.61 
 
 		 1101 aa  104  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.68 
 
 		 797 aa  104  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  21.37 
 
 		 579 aa  103  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  27 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2210  hypothetical protein  27.78 
 
 		 357 aa  95.5  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.179103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  49.5 
 
 		 253 aa  94.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 		 329 aa  95.1  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  22.92 
 
 		 343 aa  93.6  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 		 1118 aa  93.2  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  25.42 
 
 		 688 aa  93.2  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  27.51 
 
 		 580 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  25.36 
 
 		 342 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  36.3 
 
 		 277 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  48.91 
 
 		 261 aa  87.8  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  50.53 
 
 		 304 aa  88.2  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  21.06 
 
 		 583 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  43.43 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.75 
 
 		 840 aa  81.3  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  41.18 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 		 1002 aa  80.9  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  45.95 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  21.38 
 
 		 567 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  22.07 
 
 		 356 aa  79.7  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  23.37 
 
 		 356 aa  79.7  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  37.61 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  36.7 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  36.7 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  40.8 
 
 		 733 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  35 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  43 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  36.7 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  36.7 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  41.23 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 446 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  36.7 
 
 		 265 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  36.7 
 
 		 265 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  36.7 
 
 		 265 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  36.7 
 
 		 265 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  37.74 
 
 		 542 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  40 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  22.97 
 
 		 542 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  37.74 
 
 		 557 aa  75.1  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  39.81 
 
 		 544 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 620 aa  74.3  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  37.74 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  39.64 
 
 		 444 aa  73.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  40.95 
 
 		 255 aa  72.4  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  34.86 
 
 		 265 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  36.7 
 
 		 849 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  36.63 
 
 		 179 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.03 
 
 		 637 aa  71.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  37.37 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  38.83 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.11 
 
 		 631 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>