103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0307 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 426 aa  865    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  88.34 
 
 		 427 aa  764    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  56.89 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  46.39 
 
 		 418 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  35 
 
 		 374 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.69 
 
 		 433 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  31.73 
 
 		 793 aa  158  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  34.53 
 
 		 358 aa  157  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  33.12 
 
 		 426 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  32.48 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  34.56 
 
 		 349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  32.04 
 
 		 307 aa  144  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  29.28 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  27.44 
 
 		 503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  28.99 
 
 		 451 aa  131  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.46 
 
 		 1115 aa  126  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  30.3 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  28.53 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  27.86 
 
 		 343 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.53 
 
 		 1115 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  27.91 
 
 		 356 aa  124  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  22.86 
 
 		 1115 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  22.76 
 
 		 1119 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.86 
 
 		 1115 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  26.9 
 
 		 647 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  30.93 
 
 		 420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  27.91 
 
 		 428 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  27.36 
 
 		 542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  29.04 
 
 		 312 aa  113  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  29.47 
 
 		 390 aa  112  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  25.51 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  27.84 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  28.09 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  24.75 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  24.75 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  24.75 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  24.75 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  24.75 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  24.75 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  24.75 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  24.75 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  25.9 
 
 		 579 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  25.31 
 
 		 927 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  24.41 
 
 		 430 aa  103  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  25.96 
 
 		 688 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  25.57 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  27.07 
 
 		 567 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  27.27 
 
 		 484 aa  100  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  25.24 
 
 		 423 aa  96.7  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  25.24 
 
 		 444 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 		 1154 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  25.57 
 
 		 1124 aa  93.6  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  25.15 
 
 		 1118 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 		 583 aa  90.5  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  26.24 
 
 		 1101 aa  80.9  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  29.57 
 
 		 541 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  25.33 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  29.22 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  28.83 
 
 		 578 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  22.6 
 
 		 521 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  29.03 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  29.95 
 
 		 536 aa  69.7  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1268  glycosyl hydrolase-like protein  32.23 
 
 		 808 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  26.88 
 
 		 580 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2820  hypothetical protein  38.82 
 
 		 822 aa  63.5  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1613  glycosyl hydrolase-like protein  31.4 
 
 		 807 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.5027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  28.31 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  29.65 
 
 		 1115 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2210  hypothetical protein  24.17 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.179103  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  25 
 
 		 426 aa  57  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3919  chitinase II  25.5 
 
 		 695 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00105192  normal  0.0100672 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44884  chitinase glycoside hydrolase family 1  24.29 
 
 		 344 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  27.04 
 
 		 521 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  27.81 
 
 		 801 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  22.3 
 
 		 1002 aa  51.6  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  25.27 
 
 		 674 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4560  glycoside hydrolase family protein  25.25 
 
 		 340 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  23.53 
 
 		 1782 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  27.01 
 
 		 674 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  23.98 
 
 		 355 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  27.01 
 
 		 674 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  27.2 
 
 		 872 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  26.02 
 
 		 1132 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  24.9 
 
 		 536 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  27.01 
 
 		 674 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  27.01 
 
 		 674 aa  47  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  27.01 
 
 		 674 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  27.01 
 
 		 674 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  27.01 
 
 		 674 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 465 aa  46.6  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  22.66 
 
 		 373 aa  46.6  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  24.69 
 
 		 792 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  24.21 
 
 		 652 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  25.79 
 
 		 827 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  26.98 
 
 		 760 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  25.86 
 
 		 674 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  25.86 
 
 		 674 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  21.88 
 
 		 542 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  24.37 
 
 		 540 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>