98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3749 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 567 aa  1157    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  31.42 
 
 		 583 aa  281  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  32.25 
 
 		 579 aa  271  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  35.21 
 
 		 484 aa  224  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  30.07 
 
 		 444 aa  146  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  29.38 
 
 		 542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  30.69 
 
 		 374 aa  127  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  31 
 
 		 307 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.73 
 
 		 1115 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 349 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  26.86 
 
 		 1119 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.41 
 
 		 1115 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  25.33 
 
 		 793 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.54 
 
 		 1115 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  25.85 
 
 		 426 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  29.02 
 
 		 316 aa  110  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  26.47 
 
 		 384 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  26.21 
 
 		 1115 aa  108  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  26.33 
 
 		 430 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  27.99 
 
 		 420 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  27.05 
 
 		 430 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  25.62 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  25.62 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  25.62 
 
 		 430 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  25.62 
 
 		 430 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  25.62 
 
 		 430 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  25.62 
 
 		 430 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  26.33 
 
 		 430 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  27.45 
 
 		 418 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  28.27 
 
 		 430 aa  103  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  26.33 
 
 		 358 aa  103  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  28.14 
 
 		 927 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  27.07 
 
 		 426 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  24.4 
 
 		 312 aa  100  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  29.96 
 
 		 451 aa  96.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 		 427 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  24.84 
 
 		 433 aa  94.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  23.51 
 
 		 428 aa  93.2  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  26.6 
 
 		 688 aa  90.9  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  23.66 
 
 		 356 aa  89.7  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  25.21 
 
 		 428 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  26.61 
 
 		 423 aa  87.4  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  22.6 
 
 		 415 aa  87  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  24.09 
 
 		 356 aa  86.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  21.59 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  24.03 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  25.16 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 1154 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24.17 
 
 		 1101 aa  80.9  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  24 
 
 		 647 aa  80.9  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  23.38 
 
 		 1118 aa  80.5  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  21.38 
 
 		 503 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  22.62 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  24.46 
 
 		 580 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  21.75 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  25.4 
 
 		 521 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  26.77 
 
 		 1115 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  22.18 
 
 		 1124 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  28.57 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  24.14 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  19.31 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  22.99 
 
 		 1132 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  25.34 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 		 578 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  29.71 
 
 		 418 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  26.87 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  24.8 
 
 		 382 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  23.89 
 
 		 536 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  27.83 
 
 		 872 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  19.86 
 
 		 1120 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  21.57 
 
 		 355 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  23.62 
 
 		 401 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  20.54 
 
 		 1002 aa  51.2  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  26.69 
 
 		 388 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  20.99 
 
 		 377 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 		 674 aa  48.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  21.69 
 
 		 465 aa  47  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  23.93 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  25.17 
 
 		 674 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  21.97 
 
 		 674 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  22.59 
 
 		 674 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  25.17 
 
 		 674 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  25.17 
 
 		 674 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  25.17 
 
 		 674 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  25.17 
 
 		 674 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  25.17 
 
 		 674 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4560  glycoside hydrolase family protein  27.08 
 
 		 340 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3919  chitinase II  20.65 
 
 		 695 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00105192  normal  0.0100672 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  23.35 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  24.22 
 
 		 674 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  24.49 
 
 		 674 aa  45.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 		 472 aa  44.7  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  27.54 
 
 		 827 aa  44.3  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  23.87 
 
 		 542 aa  43.9  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  23.21 
 
 		 372 aa  43.9  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  21.57 
 
 		 1271 aa  43.9  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00517  conserved hypothetical protein  22.61 
 
 		 1776 aa  43.9  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>