75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2002 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  98.31 
 
 		 356 aa  733    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  746    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  74.27 
 
 		 343 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  28.53 
 
 		 374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  29.26 
 
 		 358 aa  139  7.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  25.36 
 
 		 426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.84 
 
 		 433 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  30.22 
 
 		 430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  28.75 
 
 		 307 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  24.53 
 
 		 384 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 		 427 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  29.13 
 
 		 484 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  29.39 
 
 		 647 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.77 
 
 		 1115 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  26.17 
 
 		 426 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.93 
 
 		 1115 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  24.46 
 
 		 1115 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  24.16 
 
 		 1119 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.21 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  31.6 
 
 		 415 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  24.07 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  26.49 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.55 
 
 		 1115 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  24.76 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  28.3 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 		 793 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  27.89 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  25.16 
 
 		 579 aa  99.8  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  25.21 
 
 		 542 aa  99.4  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  27.44 
 
 		 583 aa  96.3  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  27.34 
 
 		 430 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  27.34 
 
 		 430 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  25.08 
 
 		 1101 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  27.27 
 
 		 430 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  27.63 
 
 		 430 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  26.94 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  26.94 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  26.94 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  26.38 
 
 		 430 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  26.94 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  25.84 
 
 		 1118 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  26.62 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  29.78 
 
 		 580 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  27.42 
 
 		 451 aa  90.5  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  26.47 
 
 		 444 aa  90.1  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  25.63 
 
 		 688 aa  89.7  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  24.09 
 
 		 567 aa  86.7  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  24.18 
 
 		 927 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  25.53 
 
 		 1124 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  23.37 
 
 		 503 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  25.22 
 
 		 1154 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  26.63 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  22.5 
 
 		 521 aa  62.8  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  25.46 
 
 		 1782 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  30.12 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  24.31 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1379  glycosyl hydrolase-like protein  26.61 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1268  glycosyl hydrolase-like protein  31.52 
 
 		 808 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  25 
 
 		 426 aa  47  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1613  glycosyl hydrolase-like protein  28.26 
 
 		 807 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.5027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2224  hypothetical protein  28.48 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285568  hitchhiker  0.000126122 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  25.22 
 
 		 872 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  25.41 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  30.99 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  25.91 
 
 		 763 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2820  hypothetical protein  31.88 
 
 		 822 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  20.86 
 
 		 674 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  20.86 
 
 		 674 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  22.04 
 
 		 674 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>