132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2070 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 465 aa  970    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  49.8 
 
 		 1362 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 674 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  29.12 
 
 		 674 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  33.44 
 
 		 1271 aa  154  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  28.63 
 
 		 674 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  28.63 
 
 		 674 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  28.82 
 
 		 674 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  28.85 
 
 		 674 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  28.63 
 
 		 674 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  29.84 
 
 		 674 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  29.84 
 
 		 674 aa  149  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  29.84 
 
 		 674 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  28.63 
 
 		 674 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  32.35 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  34.23 
 
 		 563 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  33.22 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  29.21 
 
 		 377 aa  137  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  31.99 
 
 		 375 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  28.12 
 
 		 639 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  30.93 
 
 		 868 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  31.53 
 
 		 868 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  28.95 
 
 		 868 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  31.23 
 
 		 867 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  30.97 
 
 		 382 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  30.15 
 
 		 868 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  31.33 
 
 		 861 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  30.93 
 
 		 868 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  28.94 
 
 		 373 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  26.64 
 
 		 521 aa  124  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  30.98 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  27.6 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  30.84 
 
 		 364 aa  119  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  29.43 
 
 		 869 aa  119  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 1578 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  29.18 
 
 		 396 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  29.49 
 
 		 848 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  28.85 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  31.65 
 
 		 563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  23.97 
 
 		 634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  27.91 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  27.08 
 
 		 472 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  28.8 
 
 		 699 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  27.68 
 
 		 652 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  28.99 
 
 		 972 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  27.84 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  27.55 
 
 		 699 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  27.49 
 
 		 388 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  30.3 
 
 		 863 aa  110  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  31.08 
 
 		 868 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  35.75 
 
 		 703 aa  109  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  26.43 
 
 		 439 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  28.7 
 
 		 848 aa  108  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  27.98 
 
 		 652 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  27.94 
 
 		 699 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  36.98 
 
 		 792 aa  107  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  30.65 
 
 		 542 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  27.33 
 
 		 763 aa  106  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  27.71 
 
 		 699 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  27.71 
 
 		 699 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  26.68 
 
 		 827 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  27.78 
 
 		 463 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  25.78 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  29.11 
 
 		 855 aa  104  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  25.85 
 
 		 586 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  28.71 
 
 		 536 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  26.85 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  34.63 
 
 		 854 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  28.08 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  28.08 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  25.82 
 
 		 1246 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  26.14 
 
 		 451 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  29.3 
 
 		 540 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  26.97 
 
 		 657 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  27.83 
 
 		 1132 aa  100  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  28.06 
 
 		 662 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  25.41 
 
 		 1782 aa  99.8  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  27.07 
 
 		 505 aa  99.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  29.91 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  25.57 
 
 		 1443 aa  98.2  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  24.44 
 
 		 1051 aa  97.8  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  23.63 
 
 		 1054 aa  97.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  25 
 
 		 559 aa  97.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  27.35 
 
 		 762 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  28.23 
 
 		 675 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  24.02 
 
 		 1053 aa  95.1  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  28.31 
 
 		 425 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  26.12 
 
 		 455 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  23.36 
 
 		 1129 aa  92.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1080 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  28.06 
 
 		 532 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  23.2 
 
 		 1127 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  23.2 
 
 		 1127 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  28.94 
 
 		 651 aa  88.6  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  23.2 
 
 		 1127 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00517  conserved hypothetical protein  25.55 
 
 		 1776 aa  87.8  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  26.44 
 
 		 430 aa  87.4  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  24.25 
 
 		 1127 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  25.86 
 
 		 400 aa  87  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>