232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1100 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  75.72 
 
 		 868 aa  1352    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  49.47 
 
 		 848 aa  723    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  74.28 
 
 		 869 aa  1331    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  74.34 
 
 		 868 aa  1325    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  73.29 
 
 		 868 aa  1280    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  47.54 
 
 		 972 aa  700    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  75.49 
 
 		 868 aa  1349    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  75.61 
 
 		 868 aa  1352    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  50.12 
 
 		 855 aa  727    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  73.53 
 
 		 868 aa  1313    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  75.93 
 
 		 867 aa  1355    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  47.73 
 
 		 848 aa  729    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  74.91 
 
 		 563 aa  868    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 863 aa  1766    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  45.45 
 
 		 1271 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  35.56 
 
 		 431 aa  253  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  35.61 
 
 		 674 aa  213  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  38.59 
 
 		 985 aa  212  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  34.75 
 
 		 674 aa  207  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  34.75 
 
 		 674 aa  207  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  34.75 
 
 		 674 aa  206  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  34.75 
 
 		 674 aa  206  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  34.99 
 
 		 674 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  34.52 
 
 		 674 aa  206  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  31.37 
 
 		 674 aa  205  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  35 
 
 		 674 aa  205  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  35 
 
 		 674 aa  205  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  35 
 
 		 674 aa  205  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  26.52 
 
 		 861 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  33.26 
 
 		 652 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1080 aa  191  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  33.83 
 
 		 484 aa  187  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  31.85 
 
 		 703 aa  185  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  33.66 
 
 		 521 aa  180  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  31.14 
 
 		 639 aa  179  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  32.3 
 
 		 540 aa  173  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  31.49 
 
 		 482 aa  172  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  30.48 
 
 		 652 aa  171  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  33.18 
 
 		 854 aa  170  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  31.82 
 
 		 532 aa  167  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  32.69 
 
 		 792 aa  165  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  36.69 
 
 		 373 aa  164  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  30.52 
 
 		 505 aa  163  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  31.18 
 
 		 651 aa  162  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  31.47 
 
 		 430 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  29.88 
 
 		 559 aa  162  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  30.05 
 
 		 398 aa  160  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  35.48 
 
 		 388 aa  160  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  29.91 
 
 		 414 aa  160  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  36.3 
 
 		 377 aa  158  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  27.96 
 
 		 699 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  27.96 
 
 		 699 aa  156  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  29.05 
 
 		 762 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  28.32 
 
 		 699 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  27.78 
 
 		 699 aa  154  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  28.14 
 
 		 699 aa  154  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 		 540 aa  154  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  30.51 
 
 		 662 aa  148  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  29.4 
 
 		 539 aa  147  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  29.81 
 
 		 542 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  31.33 
 
 		 425 aa  146  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  28.67 
 
 		 451 aa  144  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  27.25 
 
 		 536 aa  143  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  34.87 
 
 		 364 aa  143  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  32.12 
 
 		 401 aa  142  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  27.78 
 
 		 455 aa  141  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  29.51 
 
 		 463 aa  140  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  27.97 
 
 		 439 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  28.61 
 
 		 372 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  27.94 
 
 		 400 aa  138  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  30.25 
 
 		 472 aa  134  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  26.43 
 
 		 675 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  31.92 
 
 		 355 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  32.04 
 
 		 586 aa  128  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  31.05 
 
 		 763 aa  127  8.000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  25.97 
 
 		 407 aa  127  9e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  28.46 
 
 		 366 aa  127  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  27.38 
 
 		 1362 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  31 
 
 		 382 aa  125  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  26.97 
 
 		 1578 aa  124  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  28.65 
 
 		 499 aa  121  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  31.63 
 
 		 1782 aa  121  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  25.54 
 
 		 1146 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  27.16 
 
 		 396 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  30.43 
 
 		 563 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  23.94 
 
 		 657 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 		 1127 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  25.27 
 
 		 1127 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  30.3 
 
 		 465 aa  110  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  25.27 
 
 		 1127 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  25.46 
 
 		 1127 aa  109  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  26.61 
 
 		 1051 aa  108  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  24.81 
 
 		 904 aa  104  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  25 
 
 		 772 aa  103  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  24.9 
 
 		 855 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  23.75 
 
 		 760 aa  103  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 1129 aa  103  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  25.37 
 
 		 1443 aa  101  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  28.86 
 
 		 1132 aa  100  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  27.72 
 
 		 1246 aa  98.6  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>