194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2719 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3559  chitinase  59.29 
 
 		 997 aa  859    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  68.36 
 
 		 1127 aa  1591    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  53.3 
 
 		 1146 aa  1053    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  58.72 
 
 		 855 aa  783    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 1129 aa  2314    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  56.03 
 
 		 904 aa  853    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  69.16 
 
 		 1127 aa  1615    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  53.54 
 
 		 1054 aa  997    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  54.73 
 
 		 1051 aa  932    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  47.58 
 
 		 760 aa  686    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  59.82 
 
 		 772 aa  809    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  68.8 
 
 		 1127 aa  1606    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  68.44 
 
 		 1127 aa  1593    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  52.59 
 
 		 1053 aa  978    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  38.86 
 
 		 484 aa  222  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  29.51 
 
 		 372 aa  186  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  28.09 
 
 		 674 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  28.21 
 
 		 674 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  28.09 
 
 		 674 aa  176  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  28.21 
 
 		 674 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  28.21 
 
 		 674 aa  175  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  27.9 
 
 		 674 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  28.09 
 
 		 674 aa  173  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  27.82 
 
 		 674 aa  173  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  27.49 
 
 		 674 aa  172  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 		 652 aa  171  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  27.31 
 
 		 674 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  27.5 
 
 		 674 aa  168  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  28.32 
 
 		 703 aa  167  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  27 
 
 		 482 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  29.01 
 
 		 634 aa  155  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  36.36 
 
 		 846 aa  152  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  28.09 
 
 		 431 aa  148  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  34.88 
 
 		 1152 aa  147  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  26 
 
 		 1271 aa  137  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  29.6 
 
 		 639 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  32.95 
 
 		 846 aa  131  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  25.51 
 
 		 559 aa  126  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  27.89 
 
 		 848 aa  124  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  25.16 
 
 		 499 aa  124  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  27.22 
 
 		 848 aa  123  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  26 
 
 		 855 aa  123  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  25.29 
 
 		 377 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  26.65 
 
 		 521 aa  120  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  33.21 
 
 		 848 aa  117  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  33.46 
 
 		 846 aa  117  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  29.66 
 
 		 414 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  25.49 
 
 		 396 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  30.29 
 
 		 401 aa  115  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  25.81 
 
 		 652 aa  115  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  24.43 
 
 		 505 aa  114  8.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  26.39 
 
 		 854 aa  114  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1080 aa  114  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  27.92 
 
 		 869 aa  112  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  24.9 
 
 		 762 aa  111  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  24.75 
 
 		 868 aa  110  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  29.81 
 
 		 425 aa  110  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  25.92 
 
 		 868 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  24.5 
 
 		 868 aa  108  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  29.27 
 
 		 867 aa  108  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  28.45 
 
 		 455 aa  108  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1406 aa  107  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  30.66 
 
 		 373 aa  107  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  25.51 
 
 		 355 aa  106  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  27.11 
 
 		 763 aa  106  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  29 
 
 		 868 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 868 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  25.2 
 
 		 563 aa  105  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  36.17 
 
 		 1123 aa  104  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  26.69 
 
 		 398 aa  104  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  27.95 
 
 		 430 aa  104  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 863 aa  103  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  23.93 
 
 		 1578 aa  103  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  25.47 
 
 		 972 aa  102  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  27.17 
 
 		 463 aa  102  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  29.3 
 
 		 1132 aa  101  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  27.96 
 
 		 382 aa  100  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  27.53 
 
 		 1782 aa  100  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  29.1 
 
 		 586 aa  100  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  28.57 
 
 		 388 aa  99.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  27.53 
 
 		 1246 aa  97.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  24.2 
 
 		 472 aa  97.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  24.93 
 
 		 451 aa  96.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  27.35 
 
 		 1443 aa  95.5  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  28.97 
 
 		 675 aa  92.8  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  30.32 
 
 		 1285 aa  92.8  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  23.36 
 
 		 465 aa  92.4  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  22.36 
 
 		 657 aa  92.4  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  26.42 
 
 		 868 aa  91.7  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  23.63 
 
 		 407 aa  88.2  9e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  26.21 
 
 		 662 aa  87  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  25.88 
 
 		 426 aa  87.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  29.28 
 
 		 1219 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  23.14 
 
 		 364 aa  86.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  32.16 
 
 		 1047 aa  85.9  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00541  conserved hypothetical protein  24.7 
 
 		 1598 aa  85.1  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  26.34 
 
 		 1362 aa  84.7  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  27.78 
 
 		 536 aa  84.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  29.1 
 
 		 532 aa  84.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  27.43 
 
 		 542 aa  84  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>