217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1945 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 1047 aa  1995    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  55.44 
 
 		 675 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  58.81 
 
 		 482 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  54.63 
 
 		 1219 aa  392  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  48.02 
 
 		 499 aa  369  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  50.65 
 
 		 1096 aa  323  9.000000000000001e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  46.1 
 
 		 1141 aa  300  7e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  42.39 
 
 		 827 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  39.9 
 
 		 1152 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.66 
 
 		 587 aa  182  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.65 
 
 		 587 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  36.46 
 
 		 1406 aa  145  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  41.49 
 
 		 606 aa  144  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.9 
 
 		 612 aa  142  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  43.85 
 
 		 606 aa  140  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  44.16 
 
 		 343 aa  137  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  38.24 
 
 		 1285 aa  132  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.65 
 
 		 626 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.96 
 
 		 626 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1452 aa  124  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  37.5 
 
 		 1146 aa  123  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.79 
 
 		 1143 aa  115  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  37.32 
 
 		 1127 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  36.97 
 
 		 1127 aa  115  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  37.32 
 
 		 1127 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  32.38 
 
 		 12684 aa  110  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  31.13 
 
 		 744 aa  109  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  36.46 
 
 		 1127 aa  109  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  33.57 
 
 		 1332 aa  108  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  31.82 
 
 		 846 aa  108  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  37.45 
 
 		 1054 aa  107  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  40.4 
 
 		 491 aa  105  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  30.85 
 
 		 846 aa  105  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  28.61 
 
 		 14944 aa  104  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  35.88 
 
 		 1439 aa  99.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  36.4 
 
 		 1362 aa  99  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  32.35 
 
 		 898 aa  97.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  31.11 
 
 		 2042 aa  96.3  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  30.18 
 
 		 5743 aa  95.9  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  29 
 
 		 4761 aa  95.1  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  29.8 
 
 		 895 aa  93.6  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2709  BNR domain-containing protein  23.93 
 
 		 1554 aa  89.7  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  39.68 
 
 		 1053 aa  89.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1457 aa  89.4  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.52 
 
 		 6885 aa  88.6  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  35.27 
 
 		 916 aa  87  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  27.22 
 
 		 848 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  28.96 
 
 		 899 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  39.18 
 
 		 846 aa  86.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  30.66 
 
 		 1123 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1804 aa  85.9  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  32.16 
 
 		 1129 aa  85.5  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  36.79 
 
 		 1059 aa  85.5  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  24 
 
 		 14609 aa  85.1  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  38.02 
 
 		 1051 aa  84.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  27.67 
 
 		 1601 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  52.08 
 
 		 1031 aa  81.6  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  25 
 
 		 1224 aa  80.5  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  27.96 
 
 		 3516 aa  80.1  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  27.54 
 
 		 831 aa  79.3  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  44.79 
 
 		 663 aa  75.9  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1090  hypothetical protein  31.55 
 
 		 771 aa  75.5  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  31.37 
 
 		 1224 aa  75.1  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  56 
 
 		 767 aa  72.8  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  31.7 
 
 		 1806 aa  72  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  26.68 
 
 		 1695 aa  71.6  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  40.96 
 
 		 743 aa  71.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  30.91 
 
 		 820 aa  71.2  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  27.89 
 
 		 1529 aa  70.9  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  24.8 
 
 		 653 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  26.54 
 
 		 5561 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  27.08 
 
 		 5561 aa  68.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  33.41 
 
 		 777 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  25.88 
 
 		 5561 aa  68.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  26.81 
 
 		 5559 aa  67.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  26.81 
 
 		 5559 aa  67.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05170  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1204 aa  67  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  28.39 
 
 		 3325 aa  67  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  32.07 
 
 		 3562 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1278 aa  65.5  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  45.1 
 
 		 703 aa  65.1  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.76 
 
 		 984 aa  64.3  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  29.7 
 
 		 805 aa  64.3  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  42.62 
 
 		 991 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  30.38 
 
 		 892 aa  63.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  29.43 
 
 		 2625 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  31.14 
 
 		 4106 aa  62.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  44.34 
 
 		 1414 aa  63.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  39.67 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  29.81 
 
 		 888 aa  62.4  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  28.36 
 
 		 1424 aa  62.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  30.68 
 
 		 2704 aa  62  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  30.66 
 
 		 3586 aa  62  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1688  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1035 aa  61.6  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  30.19 
 
 		 2178 aa  61.6  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  29.74 
 
 		 4689 aa  60.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  30.67 
 
 		 1887 aa  61.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  31.37 
 
 		 1496 aa  60.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  30.47 
 
 		 3824 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  30.47 
 
 		 3739 aa  60.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>