47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05170 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05170  hypothetical protein  100 
 
 		 1204 aa  2483    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0591  putative chitinase  60.33 
 
 		 306 aa  347  8.999999999999999e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  35.65 
 
 		 962 aa  131  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  29.77 
 
 		 1152 aa  103  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  27.21 
 
 		 1146 aa  91.7  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  28.09 
 
 		 848 aa  86.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  30.77 
 
 		 1123 aa  84  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  27.02 
 
 		 1127 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  26.54 
 
 		 1127 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  30.28 
 
 		 1362 aa  75.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  28.42 
 
 		 846 aa  74.3  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  27.02 
 
 		 1127 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  26.19 
 
 		 1127 aa  72.4  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  28 
 
 		 846 aa  70.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  31.46 
 
 		 846 aa  69.7  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  40 
 
 		 703 aa  68.6  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  31.34 
 
 		 1053 aa  68.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  28.06 
 
 		 1054 aa  61.6  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  28.85 
 
 		 1285 aa  61.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 		 1129 aa  61.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  26.6 
 
 		 1051 aa  60.1  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  37.62 
 
 		 1444 aa  58.9  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  27.61 
 
 		 1047 aa  58.9  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  27.39 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  25.89 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  26.89 
 
 		 1219 aa  58.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  25.52 
 
 		 1224 aa  53.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1406 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  33.9 
 
 		 974 aa  51.6  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  28.97 
 
 		 1132 aa  51.6  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  25.66 
 
 		 778 aa  52  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.75 
 
 		 984 aa  51.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  25.41 
 
 		 1096 aa  50.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  27.27 
 
 		 550 aa  49.7  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  41.38 
 
 		 451 aa  49.3  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  25.91 
 
 		 827 aa  47.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28 
 
 		 587 aa  47.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  45.28 
 
 		 760 aa  47.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  40.68 
 
 		 574 aa  47.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1452 aa  47  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.95 
 
 		 3699 aa  46.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 		 1578 aa  46.2  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  38.67 
 
 		 767 aa  45.8  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  30.48 
 
 		 1059 aa  45.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  24.55 
 
 		 12684 aa  45.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  38.98 
 
 		 426 aa  45.1  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  37.93 
 
 		 457 aa  45.1  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>