33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0591 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0591  putative chitinase  100 
 
 		 306 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05170  hypothetical protein  60.33 
 
 		 1204 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  31.1 
 
 		 962 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  35 
 
 		 846 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  33.49 
 
 		 848 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  32.48 
 
 		 846 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  30.38 
 
 		 846 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  31.21 
 
 		 1123 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  35.43 
 
 		 1054 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  34.97 
 
 		 1285 aa  72.8  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  33.12 
 
 		 1127 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  31.17 
 
 		 1224 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  32.7 
 
 		 1051 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  32.08 
 
 		 1127 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  35.29 
 
 		 1053 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  31.1 
 
 		 14944 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  34.48 
 
 		 703 aa  62.4  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  31.03 
 
 		 1146 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  32.41 
 
 		 1127 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  30.38 
 
 		 1127 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  28.49 
 
 		 1152 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  33.14 
 
 		 12684 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  36.63 
 
 		 1444 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  28.75 
 
 		 1096 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  37.33 
 
 		 974 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  29.49 
 
 		 499 aa  52.8  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  29.17 
 
 		 1362 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  30.94 
 
 		 1047 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  28.75 
 
 		 1219 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  25.24 
 
 		 550 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  27.82 
 
 		 482 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  28.05 
 
 		 782 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4670  hypothetical protein  35.85 
 
 		 60 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>