88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5511 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  100 
 
 		 1452 aa  2903    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3246  hypothetical protein  24.44 
 
 		 2760 aa  126  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  27.9 
 
 		 1047 aa  110  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  26.51 
 
 		 1219 aa  104  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.42 
 
 		 6885 aa  100  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  30.22 
 
 		 675 aa  95.1  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  28.45 
 
 		 482 aa  93.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  28.17 
 
 		 1152 aa  92.8  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  25.77 
 
 		 1096 aa  90.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  31.14 
 
 		 1146 aa  89  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  26.82 
 
 		 846 aa  88.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  29.31 
 
 		 499 aa  83.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  30.49 
 
 		 1141 aa  80.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1406 aa  72.8  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  28.46 
 
 		 1285 aa  70.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  26 
 
 		 848 aa  70.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.16 
 
 		 587 aa  68.6  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  27.06 
 
 		 1127 aa  68.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.71 
 
 		 1143 aa  68.6  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  26.37 
 
 		 846 aa  67.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  39.06 
 
 		 3562 aa  67.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  25.2 
 
 		 1127 aa  65.9  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  26.27 
 
 		 1127 aa  64.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  30.93 
 
 		 1053 aa  63.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  25.45 
 
 		 3325 aa  63.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  28.99 
 
 		 343 aa  61.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  35.94 
 
 		 1601 aa  60.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  28.78 
 
 		 3824 aa  60.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  37.5 
 
 		 827 aa  60.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  28.78 
 
 		 3739 aa  60.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  28.19 
 
 		 1224 aa  60.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 		 1127 aa  58.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  38.3 
 
 		 846 aa  58.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1278 aa  57.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  36.67 
 
 		 703 aa  57  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  29.26 
 
 		 606 aa  57.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  40.48 
 
 		 663 aa  57  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.71 
 
 		 626 aa  56.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  32.65 
 
 		 491 aa  56.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.77 
 
 		 626 aa  56.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  28.2 
 
 		 3824 aa  56.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  31.32 
 
 		 1123 aa  56.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.95 
 
 		 12684 aa  55.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  24 
 
 		 1059 aa  55.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  27.91 
 
 		 3721 aa  55.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.82 
 
 		 3552 aa  54.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  26.07 
 
 		 3824 aa  55.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 1129 aa  54.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  26.27 
 
 		 5743 aa  54.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  21.93 
 
 		 744 aa  53.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  28.28 
 
 		 1051 aa  53.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  33.79 
 
 		 4106 aa  52.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0733  hypothetical protein  35.71 
 
 		 531 aa  52.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1688  hypothetical protein  37.35 
 
 		 1035 aa  51.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0704  16S rRNA dimethylase  38.95 
 
 		 675 aa  51.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  23.75 
 
 		 5559 aa  50.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  40.22 
 
 		 1362 aa  50.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  33.57 
 
 		 1031 aa  50.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0559  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.09 
 
 		 832 aa  50.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  34.91 
 
 		 1295 aa  50.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  37.11 
 
 		 1444 aa  50.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.93 
 
 		 612 aa  50.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  23.75 
 
 		 5561 aa  50.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 587 aa  50.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  22.49 
 
 		 2552 aa  50.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  33.07 
 
 		 606 aa  49.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1457 aa  49.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 963 aa  49.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  38.3 
 
 		 991 aa  49.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  32.33 
 
 		 1247 aa  48.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  28.21 
 
 		 14944 aa  48.5  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  37.65 
 
 		 1132 aa  48.5  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  30.48 
 
 		 1585 aa  47.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  23.44 
 
 		 5561 aa  47.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05170  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1204 aa  47.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  35.42 
 
 		 1054 aa  47.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  36.56 
 
 		 778 aa  47.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  23.44 
 
 		 5561 aa  47.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  23.44 
 
 		 5559 aa  47  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  33.33 
 
 		 1474 aa  46.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  41.1 
 
 		 767 aa  46.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  27.27 
 
 		 962 aa  47  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  33.33 
 
 		 1217 aa  45.8  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0600  hypothetical protein  29.17 
 
 		 531 aa  45.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  31.62 
 
 		 1275 aa  45.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  43.28 
 
 		 1414 aa  45.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  32.48 
 
 		 1585 aa  45.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  39.29 
 
 		 800 aa  45.1  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>