172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2328 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 		 675 aa  1300    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  49.92 
 
 		 1141 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  60 
 
 		 482 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  55.44 
 
 		 1047 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  44.74 
 
 		 1219 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  45.67 
 
 		 1096 aa  318  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  41.67 
 
 		 499 aa  282  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  51.08 
 
 		 827 aa  252  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  39.91 
 
 		 1439 aa  177  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  38.74 
 
 		 916 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  39.29 
 
 		 1152 aa  174  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.1 
 
 		 587 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  41.87 
 
 		 1496 aa  154  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.61 
 
 		 1143 aa  131  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  41.41 
 
 		 343 aa  123  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.8 
 
 		 612 aa  120  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  44.62 
 
 		 777 aa  120  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  37.1 
 
 		 606 aa  120  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.33 
 
 		 6885 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  26.42 
 
 		 14944 aa  104  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.33 
 
 		 626 aa  103  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  38.05 
 
 		 331 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  34.01 
 
 		 1406 aa  102  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.44 
 
 		 626 aa  101  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.21 
 
 		 587 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  32.56 
 
 		 1285 aa  97.4  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  28.66 
 
 		 744 aa  95.9  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1452 aa  95.9  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30.1 
 
 		 12684 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  27.48 
 
 		 1332 aa  95.5  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  30.84 
 
 		 846 aa  93.2  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  43.7 
 
 		 491 aa  92.8  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  39.11 
 
 		 1146 aa  87.8  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  41.35 
 
 		 606 aa  87  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  35.74 
 
 		 549 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  31.76 
 
 		 895 aa  84.3  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  38.76 
 
 		 577 aa  84  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  30.97 
 
 		 846 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  31.8 
 
 		 4761 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  34 
 
 		 1127 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  36.18 
 
 		 1054 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  30.72 
 
 		 1428 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  46.28 
 
 		 2178 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  28.51 
 
 		 3516 aa  78.6  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  28.31 
 
 		 1601 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  34.16 
 
 		 1127 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 		 1129 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  28.39 
 
 		 1424 aa  75.1  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  32.07 
 
 		 1362 aa  73.9  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  25.46 
 
 		 5743 aa  73.9  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1482  protein of unknown function DUF214  25.21 
 
 		 1411 aa  73.9  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.356591  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  33 
 
 		 1127 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  34.15 
 
 		 1538 aa  72  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  45.19 
 
 		 1031 aa  70.9  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  26.62 
 
 		 820 aa  70.5  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  37.75 
 
 		 534 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  26.32 
 
 		 831 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  39.13 
 
 		 663 aa  69.7  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  29.46 
 
 		 1537 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  33.88 
 
 		 2170 aa  69.7  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  37.97 
 
 		 1123 aa  67.4  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  33.17 
 
 		 1053 aa  67  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  24.13 
 
 		 1224 aa  65.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  32.45 
 
 		 1059 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  25.63 
 
 		 805 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  40.4 
 
 		 2002 aa  65.1  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  27.94 
 
 		 848 aa  64.7  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  49.37 
 
 		 767 aa  64.3  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2709  BNR domain-containing protein  21.5 
 
 		 1554 aa  62.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  37.31 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  29.14 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  29.68 
 
 		 2927 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  32.05 
 
 		 1224 aa  62.4  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  27.16 
 
 		 3325 aa  62.4  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  46.75 
 
 		 963 aa  61.6  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  22.27 
 
 		 14609 aa  61.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  29.68 
 
 		 1657 aa  60.8  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  33.85 
 
 		 1051 aa  60.8  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.64 
 
 		 5216 aa  60.1  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  28.53 
 
 		 1529 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  44.16 
 
 		 966 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.1 
 
 		 1448 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  25.83 
 
 		 1887 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0952  fibronectin, type III domain-containing protein  30.86 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  29.8 
 
 		 3562 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  31.1 
 
 		 2192 aa  58.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  37.21 
 
 		 703 aa  58.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1090  hypothetical protein  30.3 
 
 		 771 aa  57.8  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.61 
 
 		 984 aa  57.8  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  25.63 
 
 		 1295 aa  57.8  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3967  fibronectin, type III domain-containing protein  36.19 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.476574  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.75 
 
 		 915 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  29.3 
 
 		 3586 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  25.83 
 
 		 1695 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 		 1127 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  29.45 
 
 		 4689 aa  55.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  25.88 
 
 		 846 aa  55.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  30.28 
 
 		 696 aa  54.7  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  41.84 
 
 		 1414 aa  54.3  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  26.01 
 
 		 680 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>