155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0837 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  100 
 
 
895 aa  1800    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1090  hypothetical protein  95.39 
 
 
771 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.64 
 
 
232 aa  229  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  50 
 
 
392 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
245 aa  206  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  48.61 
 
 
1143 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  49.53 
 
 
1138 aa  203  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  48.6 
 
 
1505 aa  200  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  47.47 
 
 
1444 aa  191  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
272 aa  190  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  44.55 
 
 
1135 aa  189  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  41.89 
 
 
1182 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  42.4 
 
 
1142 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.58 
 
 
800 aa  171  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  41.01 
 
 
1151 aa  171  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  40.37 
 
 
276 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  38.06 
 
 
275 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  40.09 
 
 
255 aa  158  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  38.53 
 
 
247 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
277 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  38.21 
 
 
1200 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  147  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  33.47 
 
 
260 aa  146  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  38.39 
 
 
285 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  33.44 
 
 
1096 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  36.17 
 
 
292 aa  126  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  32.63 
 
 
375 aa  123  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  31.34 
 
 
1194 aa  120  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  31.27 
 
 
499 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  30.8 
 
 
1219 aa  114  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  30.87 
 
 
1047 aa  110  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  30.65 
 
 
482 aa  104  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  29.53 
 
 
346 aa  103  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0240  hypothetical protein  45.45 
 
 
649 aa  103  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9524  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  32.77 
 
 
675 aa  99.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1785  FG-GAP repeat protein  30.24 
 
 
413 aa  89.7  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  30.07 
 
 
402 aa  87.8  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2753  FG-GAP repeat-containing protein  31.19 
 
 
797 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1655  FG-GAP repeat-containing protein  27.64 
 
 
389 aa  86.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418657  normal  0.573557 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  32.29 
 
 
827 aa  82  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3417  esterase  32.57 
 
 
379 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745885  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  26.28 
 
 
1332 aa  78.2  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  30.2 
 
 
3197 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  28.96 
 
 
616 aa  76.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  26.87 
 
 
266 aa  75.5  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.36 
 
 
1490 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3929  FG-GAP repeat protein  25.26 
 
 
407 aa  73.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  26.48 
 
 
406 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  30.43 
 
 
3197 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  30.8 
 
 
2042 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2511  FG-GAP repeat-containing protein  29.74 
 
 
785 aa  72.4  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.377601  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  28.02 
 
 
296 aa  70.5  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.05 
 
 
587 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.88 
 
 
587 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  28.97 
 
 
1126 aa  69.3  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  31.43 
 
 
3586 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  30.37 
 
 
1141 aa  68.2  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  28.93 
 
 
606 aa  66.6  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  25.94 
 
 
255 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  26.32 
 
 
258 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  30.07 
 
 
3925 aa  65.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1086  hypothetical protein  27.98 
 
 
283 aa  65.1  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.978408 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  22.13 
 
 
351 aa  65.1  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  26.05 
 
 
1804 aa  64.7  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  24.59 
 
 
1951 aa  63.9  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2624  hypothetical protein  27.23 
 
 
268 aa  63.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.440357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  26.19 
 
 
438 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  32.54 
 
 
1019 aa  62.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  29.32 
 
 
606 aa  61.2  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.37 
 
 
1503 aa  60.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  25.39 
 
 
306 aa  59.7  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  29.2 
 
 
898 aa  59.3  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  27.94 
 
 
437 aa  59.7  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.7 
 
 
1118 aa  58.9  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.51 
 
 
626 aa  58.9  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  27.8 
 
 
916 aa  58.2  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6776  40-residue YVTN beta-propeller repeat protein  28.57 
 
 
273 aa  58.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  33.04 
 
 
491 aa  58.2  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.76 
 
 
601 aa  57.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.78 
 
 
1113 aa  57.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.06 
 
 
626 aa  57.8  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  27.91 
 
 
1902 aa  57.4  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  25.66 
 
 
872 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  27.86 
 
 
433 aa  57.4  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  29.17 
 
 
913 aa  57  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2709  BNR domain-containing protein  22.61 
 
 
1554 aa  55.8  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  25.61 
 
 
1275 aa  56.2  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  29.36 
 
 
343 aa  55.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.82 
 
 
612 aa  55.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.21 
 
 
1180 aa  55.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  29.31 
 
 
404 aa  54.7  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  25.18 
 
 
2528 aa  54.7  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  32.34 
 
 
1585 aa  54.3  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  30.04 
 
 
1838 aa  53.9  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  39.76 
 
 
480 aa  53.9  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0784  hypothetical protein  29.44 
 
 
190 aa  53.9  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.73 
 
 
1012 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.17 
 
 
1340 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  27.43 
 
 
752 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  26.12 
 
 
657 aa  52.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>