37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1086 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1086  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  590  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.978408 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2624  hypothetical protein  66.92 
 
 		 268 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.440357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6776  40-residue YVTN beta-propeller repeat protein  64.81 
 
 		 273 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  54.98 
 
 		 639 aa  269  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.41 
 
 		 601 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  31.71 
 
 		 266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  29.74 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  30.18 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  30.3 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 245 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  28.69 
 
 		 1138 aa  79  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  29.02 
 
 		 1143 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  27.98 
 
 		 247 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  27.9 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  27.76 
 
 		 1151 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.98 
 
 		 1505 aa  70.1  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.21 
 
 		 1200 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  27.98 
 
 		 895 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  28.24 
 
 		 1444 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  28.35 
 
 		 1182 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  24.79 
 
 		 1142 aa  62.4  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  25.31 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  28 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  26.92 
 
 		 1194 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  24.19 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  27.04 
 
 		 1135 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  30.06 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 800 aa  52.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  27.27 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  24.15 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  25.73 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.89 
 
 		 1274 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.9 
 
 		 1171 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.33 
 
 		 1503 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>