52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4526 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  100 
 
 		 255 aa  535  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  59.92 
 
 		 260 aa  318  3.9999999999999996e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  58.52 
 
 		 275 aa  292  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  56.8 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  47.09 
 
 		 1505 aa  214  8e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  48.88 
 
 		 1135 aa  202  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  44.06 
 
 		 1444 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  45.53 
 
 		 1143 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  43.19 
 
 		 1138 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 800 aa  189  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  43.29 
 
 		 392 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  42.74 
 
 		 1151 aa  185  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  41.89 
 
 		 1182 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  40.16 
 
 		 1142 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  41.67 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  40.18 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  40.09 
 
 		 895 aa  158  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  38.67 
 
 		 1200 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  33.59 
 
 		 375 aa  135  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  33.46 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  33.96 
 
 		 346 aa  122  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  30.74 
 
 		 1194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  29.48 
 
 		 292 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  27.82 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  29.66 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  26.25 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.82 
 
 		 1503 aa  72.8  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  24.62 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  25.53 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0591  hypothetical protein  28.86 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  24.8 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.43 
 
 		 1180 aa  65.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  25.81 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6776  40-residue YVTN beta-propeller repeat protein  25.82 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.87 
 
 		 1171 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1544  hypothetical protein  31.07 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.81 
 
 		 601 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2624  hypothetical protein  28.48 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.440357  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1086  hypothetical protein  28.31 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.978408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.05 
 
 		 1274 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  25.37 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  25.95 
 
 		 219 aa  48.9  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  23.12 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.42 
 
 		 1265 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  21.39 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.1 
 
 		 478 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  25 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  26.95 
 
 		 639 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>