65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1382 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  100 
 
 		 296 aa  622  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  40.08 
 
 		 351 aa  198  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  31.34 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  32.93 
 
 		 1135 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 		 1505 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  30.66 
 
 		 1151 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  33.9 
 
 		 1138 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  31.95 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  28.06 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 245 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  28.29 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  27.53 
 
 		 275 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  29.23 
 
 		 1143 aa  96.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  29.67 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 272 aa  95.5  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 232 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  28.16 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  28.98 
 
 		 1444 aa  92.4  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.73 
 
 		 1274 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.46 
 
 		 1180 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  30.51 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.2 
 
 		 1265 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  28.22 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.82 
 
 		 1503 aa  83.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.41 
 
 		 1171 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  27.45 
 
 		 1142 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 800 aa  76.3  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.47 
 
 		 1200 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  25 
 
 		 1182 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  28.02 
 
 		 895 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  27.27 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  29 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  27.41 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  25.93 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  22.99 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  26.56 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  27.6 
 
 		 217 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  24.91 
 
 		 1194 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  30.71 
 
 		 213 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  27.59 
 
 		 213 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  27.46 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  24.32 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  28 
 
 		 220 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  28 
 
 		 220 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  26.71 
 
 		 233 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  27 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  30.07 
 
 		 216 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  25.39 
 
 		 227 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  22.3 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  26.29 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  26.77 
 
 		 223 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6776  40-residue YVTN beta-propeller repeat protein  25.38 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1086  hypothetical protein  25.73 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.978408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  28.37 
 
 		 214 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  27.52 
 
 		 266 aa  46.2  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3547  hypothetical protein  24.76 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  26.47 
 
 		 639 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1628  hypothetical protein  25 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.35 
 
 		 478 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  28.06 
 
 		 1439 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0059  hypothetical protein  27.92 
 
 		 222 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  23.04 
 
 		 216 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0591  hypothetical protein  26.73 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  26.24 
 
 		 258 aa  42.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>