53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0811 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  510  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3471  hypothetical protein  26.82 
 
 
266 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.49 
 
 
1171 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.31 
 
 
1265 aa  79  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  27.39 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.95 
 
 
1180 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.18 
 
 
1503 aa  73.2  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.57 
 
 
1274 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.89 
 
 
478 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  24.09 
 
 
219 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  26.38 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  26.38 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  26.38 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1628  hypothetical protein  25.4 
 
 
308 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107421  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3305  hypothetical protein  24.64 
 
 
218 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0059  hypothetical protein  24.32 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2875  hypothetical protein  25.93 
 
 
228 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  22.99 
 
 
296 aa  56.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  23.93 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  24.56 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  23.21 
 
 
234 aa  52.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  23.17 
 
 
217 aa  52  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2270  hypothetical protein  22.52 
 
 
223 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  25.18 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  19.49 
 
 
292 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  23.68 
 
 
375 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  26.88 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2054  signal peptide  26.13 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  19.55 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  21.69 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1544  hypothetical protein  20.09 
 
 
326 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377212  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  23.98 
 
 
392 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  24.44 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06130  hypothetical protein  19.44 
 
 
246 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  21.76 
 
 
351 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  24.44 
 
 
213 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  24.63 
 
 
213 aa  45.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2650  hypothetical protein  32.99 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000246514  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  21.23 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  18.95 
 
 
1142 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  25.25 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0382  hypothetical protein  21.68 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  20.43 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  18.95 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  18.97 
 
 
1135 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1631  hypothetical protein  27.61 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  20.61 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  20.22 
 
 
232 aa  43.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  20 
 
 
232 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  23.98 
 
 
266 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  20 
 
 
1151 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3539  hypothetical protein  26.59 
 
 
514 aa  42.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.294562  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  20.99 
 
 
314 aa  42  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>