42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1192 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  64.47 
 
 
232 aa  321  8e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  64.91 
 
 
248 aa  318  3.9999999999999996e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  64.04 
 
 
232 aa  316  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  67.11 
 
 
234 aa  314  6e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  63.25 
 
 
236 aa  307  9e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  53.95 
 
 
221 aa  220  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  46.05 
 
 
227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  46.22 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  40.17 
 
 
217 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  42.67 
 
 
228 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  40.17 
 
 
217 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  40 
 
 
216 aa  156  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  37.28 
 
 
214 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  38.33 
 
 
225 aa  151  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  35.09 
 
 
213 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  35.09 
 
 
213 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  35.09 
 
 
213 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  33.91 
 
 
216 aa  138  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  31.47 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  31.58 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  31.03 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  31.03 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  30.7 
 
 
214 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.01 
 
 
1265 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  25 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0213  hypothetical protein  25.32 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.01 
 
 
1503 aa  55.5  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  23.53 
 
 
223 aa  55.5  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  25.1 
 
 
314 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2558  hypothetical protein  21.65 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000292512  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  22.01 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.74 
 
 
1171 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.85 
 
 
1274 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.62 
 
 
478 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.79 
 
 
1180 aa  45.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  25.42 
 
 
351 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  19.75 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  25.81 
 
 
243 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0598  hypothetical protein  24.68 
 
 
194 aa  43.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409551  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0612  hypothetical protein  24.68 
 
 
194 aa  43.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000107431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2875  hypothetical protein  26.62 
 
 
228 aa  41.6  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.398365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>