57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1863 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  98.59 
 
 
213 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  86.85 
 
 
213 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  67.61 
 
 
214 aa  320  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  57.01 
 
 
217 aa  262  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  56.07 
 
 
217 aa  262  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  53.24 
 
 
216 aa  229  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  53.05 
 
 
214 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  51.64 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  44.5 
 
 
216 aa  186  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  41.78 
 
 
225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  40.28 
 
 
227 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  38.16 
 
 
232 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  37.28 
 
 
232 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  39.91 
 
 
234 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  38.72 
 
 
236 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  36.84 
 
 
248 aa  157  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  37.5 
 
 
221 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  35.09 
 
 
228 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  37.04 
 
 
233 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  38.36 
 
 
220 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  38.36 
 
 
220 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  37.9 
 
 
220 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  34.74 
 
 
228 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.52 
 
 
1265 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  28.31 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25 
 
 
1503 aa  68.9  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.53 
 
 
1180 aa  65.5  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  26.34 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.41 
 
 
1274 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  24 
 
 
233 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3547  hypothetical protein  29.01 
 
 
262 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2274  hypothetical protein  27.48 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.507054 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2875  hypothetical protein  30.65 
 
 
228 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  27.59 
 
 
296 aa  52.4  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.23 
 
 
1171 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  23.38 
 
 
285 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  26.4 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  30.47 
 
 
351 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06130  hypothetical protein  29.32 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  24.12 
 
 
1444 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  28.49 
 
 
314 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  23.15 
 
 
275 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  22.56 
 
 
1135 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  24.37 
 
 
392 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  22.28 
 
 
1182 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  23.83 
 
 
260 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  25.87 
 
 
276 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  24.44 
 
 
245 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0059  hypothetical protein  29.92 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0382  hypothetical protein  25.42 
 
 
245 aa  45.4  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3305  hypothetical protein  24.09 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4538  hypothetical protein  26.61 
 
 
290 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0275466  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
800 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.09 
 
 
1505 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1544  hypothetical protein  24.76 
 
 
326 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377212  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  22.33 
 
 
292 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>