34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1631 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1631  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  486  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2202  protein of unknown function DUF1037  48.66 
 
 
240 aa  222  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.468062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2950  protein of unknown function DUF1037  48 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17810  trehalose utilization protein  46.09 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577067  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1236  protein of unknown function DUF1037  45.45 
 
 
239 aa  210  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3349  protein of unknown function DUF1037  44.3 
 
 
236 aa  210  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3468  hypothetical protein  44.4 
 
 
257 aa  208  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0388  protein of unknown function DUF1037  42.98 
 
 
260 aa  207  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22301  decreased coverage  0.00488955 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4439  protein of unknown function DUF1037  45.05 
 
 
240 aa  207  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0057675  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1570  protein of unknown function DUF1037  42.06 
 
 
240 aa  206  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1145  protein of unknown function DUF1037  41.52 
 
 
265 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2966  protein of unknown function DUF1037  44.34 
 
 
248 aa  203  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2986  hypothetical protein  43.44 
 
 
247 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102363  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3683  hypothetical protein  42.31 
 
 
249 aa  202  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3775  protein of unknown function DUF1037  44.8 
 
 
249 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0027  hypothetical protein  43.44 
 
 
259 aa  198  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4342  hypothetical protein  45.54 
 
 
269 aa  198  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  decreased coverage  0.000860336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0127  hypothetical protein  44.64 
 
 
253 aa  195  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1858  protein of unknown function DUF1037  39.74 
 
 
242 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0143  hypothetical protein  41.1 
 
 
261 aa  191  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3205  hypothetical protein  38.03 
 
 
267 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1353  protein of unknown function DUF1037  44.34 
 
 
247 aa  180  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5571  trehalose utilization-related protein  40.36 
 
 
261 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.972034  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27080  trehalose utilization protein  39.91 
 
 
261 aa  179  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4438  hypothetical protein  39.73 
 
 
261 aa  177  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319512  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2944  hypothetical protein  39.53 
 
 
261 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3808  hypothetical protein  39.27 
 
 
297 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2327  protein of unknown function DUF1037  38.39 
 
 
237 aa  175  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.74481  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0308  hypothetical protein  39.53 
 
 
269 aa  174  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3007  protein of unknown function DUF1037  37.44 
 
 
261 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3258  protein of unknown function DUF1037  37.44 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.955275  normal  0.458439 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5495  protein of unknown function DUF1037  37.21 
 
 
261 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0242413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  27.61 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  34.44 
 
 
232 aa  42  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>