19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0059 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0059  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06130  hypothetical protein  46.06 
 
 
246 aa  161  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3305  hypothetical protein  46.73 
 
 
218 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2875  hypothetical protein  45.66 
 
 
228 aa  138  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0382  hypothetical protein  41.7 
 
 
245 aa  125  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  31.16 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2270  hypothetical protein  30.13 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  24.32 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.74 
 
 
1265 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  29.92 
 
 
213 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  29.92 
 
 
213 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.32 
 
 
1274 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  26.9 
 
 
314 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  27.92 
 
 
296 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.79 
 
 
478 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  27.23 
 
 
285 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  25.24 
 
 
213 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  20.71 
 
 
1180 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  27.04 
 
 
392 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>